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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002272`

染色体: Chr04 坐标: 36855180-36859237 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002272`
名称	SmilChr04G002272
描述	pectinesterase/pectinesterase inhibitor PPE8B-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	36855180 - 36859237 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021418`
GeneID	`131021418`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021418`
原始查询	`SmilChr04G002272`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase/pectinesterase inhibitor PPE8B-like
产物	pectinesterase/pectinesterase inhibitor PPE8B-like
Arabidopsis	`AT4G33220` (PME44) pectin methylesterase 44 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829458] identity=64.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0450100` (OsPME25) - identity=54; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021418

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057806586.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806586.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806586.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806586.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806586.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:36858404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:36858428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B125,B44
`Chr4:36858446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B59,B91,C42,D6
`Chr4:36858620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,D4
`Chr4:36858653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:36858851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr4:36858870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C2
`Chr4:36858939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806586.1

508 aa

254

508

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 40-152 aa PF01095 Pectinesterase 198-492 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806586.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	40	152	7.5e-16	59.4	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057806586.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	198	492	2.8e-148	493.2	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950603.1
ATGAATCGGCCCAAAAATAAATAAATATGAGAAGCATTGATATCGAATGCCGAAGCAGAGACCTTCCTTCTTTAATATTCTCCACCTGCCCCCTATAAGCCCCTAACCCTATATAAATACACAACCCAGTCTATTTATTACACAAACATTCTTCAAATCCAATATTGACCATTTCTTTCATGCAAATTACTCTCTCTCACTCCCCTTAACCATTTTCATATCATATGCTCTTAATCCTTTTCTACGTTTAAGAATCGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021418
ATGGGGTCAAATTTCTTGAAACTTGTGTTTGTAGTGACGATTTTAAGCTGTGCGAGTGGTGAGAAGGCGTCGGAGTTTGGAAACTTGAAGGTTCCGGCGTCGGAATTTGTGGGATCGGTGAGGTCCACCATCGACATAATCCGGCAAGTGATGTCCATAGTGTCGCGGTTTTCCGGCGCATTCGGCGATTTCCGGCTGAGTAATGCCGTCTCCGACTGCCTCGATTTGATGGATCTCTCCGTGGACCAGTTGAGCTGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806586.1
MGSNFLKLVFVVTILSCASGEKASEFGNLKVPASEFVGSVRSTIDIIRQVMSIVSRFSGAFGDFRLSNAVSDCLDLMDLSVDQLSWTISASQNPNGKDNGTGNVKADMKTWLSGTLINQDTCKEGFDGTNGIVRDLVAGSLDQVTSLVYNILSNINPTPTTPPPSGAGRGGRKLISTQDFPDWFKPNDRRLLQAATADVVVAADGTGKFTSIMDAIGAAPEHSSKRFVIYVKKGVYKEYVEISKKKWNIMMIGDGVNATV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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