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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002274`

染色体: Chr04 坐标: 36924053-36927670 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002274`
名称	SmilChr04G002274
描述	pectinesterase-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	36924053 - 36927670 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021420`
GeneID	`131021420`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021420`
原始查询	`SmilChr04G002274`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase-like
产物	pectinesterase-like
Arabidopsis	`AT5G20860` (AT5G20860) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832209] identity=50; qcov=1.02; evalue=2.66e-174; confidence=high
Rice	`Os07g0675100` (OsPME22) - identity=43; qcov=1.01; evalue=2.63e-122; confidence=medium
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021420

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057806588.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057806588.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806588.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806588.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806588.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:36924216`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B119,C23,C77
`Chr4:36924216`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B119,C23,C77
`Chr4:36924219`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B119,C23,C77
`Chr4:36924219`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B119,C23,C77
`Chr4:36924240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:36924273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:36924316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr4:36924368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B76,C49
`Chr4:36925107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr4:36925179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr4:36925211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:36925213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806588.1

525 aa

262

525

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 32-178 aa PF01095 Pectinesterase 217-510 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806588.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	32	178	3.4e-23	83.2	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057806588.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	217	510	4.5e-116	387.5	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950605.1
CAACATGCACACTCATCTTTCACCCTATAAAAGTGCAGCAATTTATTCACTATCCATTCACACAAACACCCACAGAATACTTGGACATTACTTTTTCCAAAGAAAAAAAAGCACTTGTTTTAAGCGCTCTTTCATATATTGTTGAGAGTGATGGAACCATCAAAATATATTGTAATTGTATTCTTGGCAATAACATGTTTTAGTGCAGTGTCATGGGCAAGAAATGTGGATTATGAAGAGGCAGTGAGGGGTGAATGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021420
ATGGAACCATCAAAATATATTGTAATTGTATTCTTGGCAATAACATGTTTTAGTGCAGTGTCATGGGCAAGAAATGTGGATTATGAAGAGGCAGTGAGGGGTGAATGTTCTTACACAAGATATCCAACATTGTGTGGCGAAACTTTGACACAATTAGGGTCACATGATCGAAATATTGACTTTTTGTCTATCCTTGTTAACGACACCATTTCACAGACCAAGATGCCCGATACCAATTCCTACGCCTCCTCTAATTCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806588.1
MEPSKYIVIVFLAITCFSAVSWARNVDYEEAVRGECSYTRYPTLCGETLTQLGSHDRNIDFLSILVNDTISQTKMPDTNSYASSNSISPNSQLIQTATDYCDELMEMSVKRLKQAMELVQKSPKKHKADIQTWLSAALTFQEACRDTIEEHVAADAHAAEIYKRIDHLSKLGSNSLALANRISGGPAGRRLLEGGDFPAWVTGSERRLLQSAAVTANAVVAKDGSGDFKSVGEAINAAAGGRYVIYVKAGTYNEKISTNK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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