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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002275`

染色体: Chr04 坐标: 36958037-36971581 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002275`
名称	SmilChr04G002275
描述	conserved oligomeric Golgi complex subunit 3
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	36958037 - 36971581 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021421`
GeneID	`131021421`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021421`
原始查询	`SmilChr04G002275`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	conserved oligomeric Golgi complex subunit 3
产物	conserved oligomeric Golgi complex subunit 3
Arabidopsis	`AT1G73430` (AT1G73430) sec34-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843677] identity=78.3; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0451000` - identity=72.4; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005801 (cis-Golgi network); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006891 (intra-Golgi vesicle-mediated transport); GO:0007030 (Golgi organization); GO:0016020 (membrane); GO:0017119 (COG complex)
KEGG	-
Pfam	PF04136 (COG3_N); PF20671 (COG3_C); PF31184 (COG3_Ccap)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021421

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057806589.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057806589.1`
3	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057806589.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057806589.1`
5	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.40000	`XP_057806589.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:36958612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:36959326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:36959339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:36961471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr4:36963803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B52,B6,C63
`Chr4:36964893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B34,C6
`Chr4:36965038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	58	A1,A11,A14,A18,A19,A24,A9,B103,B106,B109,B112,B114,B124,B126,B131,B132,B138,B140,B28,B32,B37,B4,B41,B45,B49,B5,B54,B57,B65,B7,B71,B72,B79,B95,C1,C11,C12,C16,C20,C22,C31,C33,C38,C4,C49,C50,C61,C65,C66,C68,C72,C77,C79,C83,D11,D2,D3,D8
`Chr4:36967305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B76,B98,C49,C80
`Chr4:36967397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr4:36970501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:36970939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806589.1

784 aa

392

784

COG3_N

COG3_C

COG3_Ccap

PF04136 COG3_N 119-262 aa PF20671 COG3_C 289-597 aa PF31184 COG3_Ccap 642-783 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806589.1`	Pfam	`PF04136`	COG3_N	Repeat	119	262	3.6e-43	147.7	Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, N-terminal
`XP_057806589.1`	Pfam	`PF20671`	COG3_C	Repeat	289	597	4.6e-105	351.9	Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, C-terminal
`XP_057806589.1`	Pfam	`PF31184`	COG3_Ccap	Domain	642	783	2.7e-74	248.5	COG3 C-terminal cap domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950606.1
GCACATAGGCTATAACTATATATGAATTTTCTTATTTTAAAAAAATTGAAAAATGCATATAGAGAAATATTCAGAACATTGTTTTGGGGGAAATTATAGTAGCTGATTTTTTAGGATGTTTAGTTTACCTCTCTCCTCTCACTGTCTGTTTCCCGTTTTCGCTTAGCTTCTTCCGTCTGATTCCCTGAGCTTCACCCCACCGCCGATCTATCACTCGCCACCACCGCTTTCGCCACCCGCCCACGAGCCGCCACCGTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021421
ATGGCTGCAGTCACTCCGGTGGGTGCGGGGAAGGCTGGTCTCGCGAAATCCGGTGCAATCTCCAAAGGCTACAACTTTGCCTCCGCCTGGGAACAGAATGCTCCATTGACAGAGCAACAACAGGCAGCAATTGTTGCACTCTCCCATGCTGTTGCTGAACGGCCATTTCCTCCAAATTTGGCACAAGATAAAGTAGCTGGACTGGAAAATGGTCTGTCTATTTCGACAAAGCACAGCACTGCAGAAGATTCAGGTGTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806589.1
MAAVTPVGAGKAGLAKSGAISKGYNFASAWEQNAPLTEQQQAAIVALSHAVAERPFPPNLAQDKVAGLENGLSISTKHSTAEDSGVIDAVLVNTNEFYKWFADLEAAMKSETEEKYQHYVRTLTERIQTCDTILNQVDETLELFNELQLQHQAVATKTKTLHDACDRLVVEKQRLIEFAESLRAKLNYFDELENVATSFYSPSMNVAHENFLPLLKRLDDCISYVESNPQYAECNVYLVKFRQLQSRALGMIRSHVLSVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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