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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002290`

染色体: Chr04 坐标: 37184289-37185503 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002290`
名称	SmilChr04G002290
描述	protein TIFY 10A-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37184289 - 37185503 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021433`
GeneID	`131021433`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021433`
原始查询	`SmilChr04G002290`

查看完整 ID 对照表

文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名	Accession	当前 ID	比对	置信度	来源
`SmJAZ1` CORE-060; 2015	`JQ936590`	`LOC131021433` `SmilChr04G002290` GeneID 131021433	nucleotide CDS and protein BLAST against active nuclear reference, 2026-09-27; identity 99.632%; coverage 100.0%	Exact or near-exact sequence match	DOI

打开完整文献证据

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIFY 10A-like
产物	protein TIFY 10A-like
Arabidopsis	`AT1G19180` (JAZ1) jasmonate-zim-domain protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838501] identity=36; qcov=1.27; evalue=1.71e-30; confidence=medium
Rice	`Os03g0402800` (OsJAZ5) - identity=34.6; qcov=1.17; evalue=1.08e-24; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0009611 (response to wounding); GO:0031347 (regulation of defense response); GO:2000022 (regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06200 (tify); PF09425 (Jas_motif)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021433

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806603.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806603.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806603.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806603.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806603.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37184569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,A5,B48
`Chr4:37184862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B110
`Chr4:37184889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:37184919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:37185234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806603.1

180 aa

180

tify

Jas_motif

PF06200 tify 79-106 aa PF09425 Jas_motif 130-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806603.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	79	106	3.4e-15	55.8	tify domain
`XP_057806603.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	130	155	5.4e-15	55.6	Jas motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950620.1
AATAATGCTGGAATCATAATTAGGTCTCTTTAGAAAGAAAGCCGGCAACCACAGCTGTCCACTATAAGGGCCCCGCATTTAAAAAATGCCATTCCACCACAAGTTCCTCATGCTCCTTTTATTGTTATACTCCTAATCTTTATCAACAATATATAAAGATCATCATCTTCCCCATTCAATCCCAACACAACAAATACTTTTCTTTCCTTCAATTGGTCAACGAGCTTCCATATAATATCTCTCTCCGATCGGAGCAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021433
ATGGTTTCGCCGGAAAAAGTTGATTCCGGCAAGTTTCACGGCGGCAGGTCCAACTTCTCGCAAACGTGCACCCTTCTCAGCCAGTACTTGAAGGAGAGGGGCAACTTCGGTGGCCTCACCCTTAACCTGAACCCTAATTTTCCTGAAACCCCCAAAGGGACTGTGAATCTATTGCCAAAGATTGAGCAACCGGATCAGAATCCGAGTGAGCCGAAACCAGAAAAGGAAATTGGGCAGATGACGATATTTTACGCGGGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806603.1
MVSPEKVDSGKFHGGRSNFSQTCTLLSQYLKERGNFGGLTLNLNPNFPETPKGTVNLLPKIEQPDQNPSEPKPEKEIGQMTIFYAGQVIVLDDIPADKAKEIINLATSYPSAAAVKPHAPQLPPLGSDLPIARKNSLARFLEKRKDRITGTAPYQASKPAVKAEPWLEMGSQYPLQIQRH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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