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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002294`

染色体: Chr04 坐标: 37215355-37216092 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002294`
名称	SmilChr04G002294
描述	uncharacterized SmilChr04G002294
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37215355 - 37216092 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023387`
GeneID	`131023387`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023387`
原始查询	`SmilChr04G002294`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922]; symbol=AT3G47680; hit=AT3G47680; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922]; symbol=AT3G47680; hit=AT3G47680; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=27.7; qcov=0.412; evalue=1.77e-07; confidence=low
Rice	`Os12g0228500` - identity=23.8; qcov=0.788; evalue=6.34e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023387

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808908.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808908.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808908.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808908.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808908.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37215407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B18,C79,C81
`Chr4:37215418`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B28,B54,B58,B66,B71,B93,C33,C62
`Chr4:37215459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr4:37215466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B80,B85,B94,C27
`Chr4:37215494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C46,C55,C58
`Chr4:37215495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B55,B59,B74,B80
`Chr4:37215543`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A8,B100,B2,B75,C33,C45,D5
`Chr4:37215566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr4:37215574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C27
`Chr4:37215576`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A20,B104,B28,B56,C47
`Chr4:37215576`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A20,B104,B28,B56,C47
`Chr4:37215591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952925.1
ATGTCTGTTTGGTGCTTTGTCAGTAACAATCCAATTGTTGGCACTAACCGAAATAGTAAGTCGTTTTGGAAAACTGTTGCAGATATGTATGAGCAAAGTCGAGCAGATAATCCAGAAATTGGAGGTCGAAGGAGCGTGGAATCATTGAGGAACCGTTACAAACACCTCAACAAAAATGTAGCTCTGTGGGTTGCTGCATACAAGAAAGCATATGAGCGACGAGCAAGCGGTCAGTCCAAAGAGGATATCGAGAAAGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023387
ATGTCTGTTTGGTGCTTTGTCAGTAACAATCCAATTGTTGGCACTAACCGAAATAGTAAGTCGTTTTGGAAAACTGTTGCAGATATGTATGAGCAAAGTCGAGCAGATAATCCAGAAATTGGAGGTCGAAGGAGCGTGGAATCATTGAGGAACCGTTACAAACACCTCAACAAAAATGTAGCTCTGTGGGTTGCTGCATACAAGAAAGCATATGAGCGACGAGCAAGCGGTCAGTCCAAAGAGGATATCGAGAAAGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808908.1
MSVWCFVSNNPIVGTNRNSKSFWKTVADMYEQSRADNPEIGGRRSVESLRNRYKHLNKNVALWVAAYKKAYERRASGQSKEDIEKAAQAIYGKPKFTHHEVFEKVMSSYPNWELKLDSTGYVRRSHPYDKDSVDESHSSSKKSRTNEDVDPPTDSTLETPGSDASKFHRPIGRDKAKAKAKRKGKQTESQSSIVSDAFTAELREMRITCEKEMKTSTLNTLMKKNQLSPDEEALKRRLIAELYGI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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