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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002297`

染色体: Chr04 坐标: 37224694-37228175 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002297`
名称	SmilChr04G002297
描述	uncharacterized SmilChr04G002297
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37224694 - 37228175 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021437`
GeneID	`131021437`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021437`
原始查询	`SmilChr04G002297`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021437

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806605.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057806605.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806605.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806605.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806605.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37224881`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	32	A2,A9,B108,B111,B117,B12,B122,B127,B18,B25,B34,B4,B55,B56,B6,B60,B65,B68,B69,B77,B96,B98,C14,C20,C38,C44,C5,C67,C7,C72,D2,D8
`Chr4:37224886`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A2,A9,B108,B111,B117,B12,B122,B127,B18,B25,B34,B4,B55,B56,B6,B60,B65,B68,B69,B77,B96,B98,C14,C20,C38,C44,C5,C67,C7,C72,D2,D8
`Chr4:37224928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	38	A13,A14,A15,A20,B1,B10,B103,B107,B115,B123,B124,B130,B133,B16,B20,B24,B33,B42,B43,B48,B53,B67,B76,B93,B95,C12,C29,C33,C48,C53,C54,C61,C71,C73,C76,C86,D1,D10
`Chr4:37225095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B42,B43,C73,D11
`Chr4:37225136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A10,B100,B118,B37,B85,B94,C30,C4,C50,C56,D6
`Chr4:37225174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:37225181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	80	A13,A18,A19,A22,A25,A4,A6,B109,B11,B113,B114,B118,B119,B12,B126,B132,B134,B17,B21,B22,B23,B26,B3,B30,B31,B36,B40,B42,B43,B45,B46,B47,B62,B64,B7,B70,B72,B73,B74,B76,B80,B83,B87,B94,B95,B97,B98,C11,C13,C2,C21,C24,C25,C3,C39,C4,C43,C44,C47,C49,C52,C56,C58,C61,C64,C65,C66,C69,C7,C73,C77,C78,C79,C80,C82,C85,D10,D11,D5,D9
`Chr4:37225198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:37225213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B42,B43,C73,D11
`Chr4:37225395`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B120,B46,B62,B67,C45
`Chr4:37225395`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B120,B46,B62,B67,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100950.1
AGGGCTAGGGCATCAAATCAGAATTTTGAATTCAGATTCAGCCCGTCTCTCAACTCTCACATCTCCACGCCCTTCACGCCCTTCCTGTCTCTAGCTCCACGCCCTTCCGTCTGCCTCTGGCGACCGGTGTCCCGTCCCACAGGCCATCGGAGCCGGTGGAATCTCCAGCGCTGCCGCGCCCATCTCCCTCTGCACCCTCTTTTCTCTCTCTCTCACCTCTCTCCAGCGCCGCCGCGCCCGTCTGCCAGAATCTTGCCACC...

XR_009100949.1
GGCTAGGGCATCAAATCAGAATTTTGAATTCAGATTCAGCCCGTCTCTCAACTCTCACATCTCCACGCCCTTCACGCCCTTCCTGTCTCTAGCTCCACGCCCTTCCGTCTGCCTCTGGCGACCGGTGTCCCGTCCCACAGGCCATCGGAGCCGGTGGAATCTCCAGCGCTGCCGCGCCCATCTCCCTCTGCACCCTCTTTTCTCTCTCTCTCACCTCTCTCCAGCGCCGCCGCGCCCGTCTGCCAGAATCTTGCCACCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021437
ATGTGGACTTCATGGACAGGGAGCCTAATAAATTATCAGGGGCACAACACAAGAGGATGCAAGAATGAGAAGTGTGATCCACCACCTAAAGAAAAGAGAAGAATAGGGAGACCAGCTAAAGCTCAATCAGAGGCTCAATCAAGCCAAGTAACTGGTACAGGGACTAGCTCCCTTACAAATGCAGCTTCTCAGGCTAACCCTCGAGCTCCCACATCACTCCCACTCCAAGTGAGAAAAACAATTGCAAAGGAGAGAGCACT...

LOC131021437
ATGACATGTAAGAAGTGTTGGCAGCAGGGGCACAACACAAGAGGATGCAAGAATGAGAAGTGTGATCCACCACCTAAAGAAAAGAGAAGAATAGGGAGACCAGCTAAAGCTCAATCAGAGGCTCAATCAAGCCAAGTAACTGGTACAGGGACTAGCTCCCTTACAAATGCAGCTTCTCAGGCTAACCCTCGAGCTCCCACATCACTCCCACTCCAAGTGAGAAAAACAATTGCAAAGGAGAGAGCACTTGCAAGGAAAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806605.1
MWTSWTGSLINYQGHNTRGCKNEKCDPPPKEKRRIGRPAKAQSEAQSSQVTGTGTSSLTNAASQANPRAPTSLPLQVRKTIAKERALARKGIGTMVTESGNIYVRGSTKQRGSIFINPKKVSELPSTQESGNDGV

XP_057806606.1
MTCKKCWQQGHNTRGCKNEKCDPPPKEKRRIGRPAKAQSEAQSSQVTGTGTSSLTNAASQANPRAPTSLPLQVRKTIAKERALARKGIGTMVTESGNIYVRGSTKQRGSIFINPKKVSELPSTQESGNDGV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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