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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002331`

染色体: Chr04 坐标: 37622098-37622541 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002331`
名称	SmilChr04G002331
描述	uncharacterized SmilChr04G002331
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37622098 - 37622541 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023393`
GeneID	`131023393`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023393`
原始查询	`SmilChr04G002331`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0683500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0683500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0683500` - identity=29.6; qcov=0.898; evalue=1.44e-06; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023393

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808915.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057808915.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808915.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808915.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808915.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37622153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	32	A11,B120,B124,B138,B140,B46,B50,B53,B56,B57,B58,B62,B66,B67,B79,B85,B88,B96,C11,C21,C27,C29,C36,C38,C39,C45,C55,C69,C72,C8,D4,D8
`Chr4:37622322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B31,B76,D10
`Chr4:37622326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B40,B68,B8
`Chr4:37622330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B9
`Chr4:37622330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr4:37622337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B73,B89
`Chr4:37622348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B135,B25,B38,B39,B59,B66,B89,C27,C55
`Chr4:37622374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr4:37622390`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	85	A14,A2,A22,A23,A4,A5,A6,B1,B102,B104,B107,B109,B113,B115,B12,B123,B136,B137,B14,B18,B19,B2,B20,B21,B24,B26,B27,B28,B30,B33,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B45,B49,B55,B61,B7,B78,B80,B81,B82,B84,B85,B86,B87,B91,B94,B97,C1,C10,C18,C20,C25,C27,C30,C31,C32,C35,C37,C44,C48,C52,C54,C57,C58,C62,C67,C76,C77,C78,C79,C8,C83,C86,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr4:37622394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B76,D10,D2
`Chr4:37622404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B9,D2
`Chr4:37622404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808915.1

147 aa

147

RVT_3

PF13456 RVT_3 8-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808915.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	8	114	4.8e-15	56.3	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952932.1
ATGGGTGCTCCGGGAAGCATTGCAGCTGGTGGTGTTTTCAGGGATCATTGGGGCTGGGTCCGGGGCTGTTACCACTTTAAAGGTGGAACGGGTTTTGCCTTTGAGGCAGAACTCCTTGCCGTGATTTATGCTATTACAATTGCGCATCAAAGATGTTGGCTAATGTTGTGGATTGAAGAGGACTCTGCTTATATTGTTCGTCTGTTGGAGGCTAGGTCGCTAGACGTTCCCTGGCGTTTCATGGCAGCTTGGAAGAAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023393
ATGGGTGCTCCGGGAAGCATTGCAGCTGGTGGTGTTTTCAGGGATCATTGGGGCTGGGTCCGGGGCTGTTACCACTTTAAAGGTGGAACGGGTTTTGCCTTTGAGGCAGAACTCCTTGCCGTGATTTATGCTATTACAATTGCGCATCAAAGATGTTGGCTAATGTTGTGGATTGAAGAGGACTCTGCTTATATTGTTCGTCTGTTGGAGGCTAGGTCGCTAGACGTTCCCTGGCGTTTCATGGCAGCTTGGAAGAAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808915.1
MGAPGSIAAGGVFRDHWGWVRGCYHFKGGTGFAFEAELLAVIYAITIAHQRCWLMLWIEEDSAYIVRLLEARSLDVPWRFMAAWKKALRLLEEFSVHVSHIFREGNCVADLMANPAMPEGWWPYARDEIKHAVVKDMATHSHVRIKH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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