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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002336`

染色体: Chr04 坐标: 37694573-37696627 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002336`
名称	SmilChr04G002336
描述	F-box protein At1g47056-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37694573 - 37696627 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021473`
GeneID	`131021473`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021473`
原始查询	`SmilChr04G002336`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At1g47056-like
产物	F-box protein At1g47056-like
Arabidopsis	`AT1G47056` (VFB1) VIER F-box protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841121] identity=50.2; qcov=0.961; evalue=6.38e-153; confidence=high
Rice	`Os04g0505700` (OsFbox227) - identity=48.3; qcov=0.703; evalue=6.62e-94; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF13516 (LRR_6); PF25372 (LRR_FBXL15)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021473

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057806652.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057806652.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806652.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806652.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806652.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37695322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B90,B92,C3,C87
`Chr4:37696236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C68,C82
`Chr4:37696400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B140,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806652.1

462 aa

231

462

F-box

LRR_FBXL15

LRR_6

PF00646 F-box 28-55 aa PF25372 LRR_FBXL15 253-420 aa PF13516 LRR_6 303-316 aa PF13516 LRR_6 370-392 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806652.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	28	55	8.4e-05	23.0	F-box domain
`XP_057806652.1`	Pfam	`PF25372`	LRR_FBXL15	Repeat	253	420	2.3e-15	56.7	F-box/LRR-repeat protein 15, leucine rich repeat domain
`XP_057806652.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	303	316	7.5e-12	45.1	Leucine Rich repeat
`XP_057806652.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	370	392	7.5e-12	45.1	Leucine Rich repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950669.1
TACAACAATTCCCATCCATCCAAACTCAAATCAGTTTTCTCCCCCAAAACCACCTCCACACCCACCAACTTCGCCCTTCTACGACGGCGGCGCGTGTTATGGACGTGCCCTCGTGAGAGGATCCGGAGATGGGTCAAGCCACCTCCACCCACGGCCATAACCCGGGCGAGCCGTCCGCCGACAACCAAGAACAAGACTTCACCTCCGCTATCCCCGACGGATGTCTAGCCTTGATCTTCCAACGCCTGAGCTACGATGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021473
ATGGGTCAAGCCACCTCCACCCACGGCCATAACCCGGGCGAGCCGTCCGCCGACAACCAAGAACAAGACTTCACCTCCGCTATCCCCGACGGATGTCTAGCCTTGATCTTCCAACGCCTGAGCTACGATGACAGGAACAACTGCCTATTGGTCTGCCGCCGCTGGCTTGTGGTGGAGGGCCAGAACCGTCGCCGCCTCGCCCTCAACGCCTCCAGCCGCGTCACCATCCGCCTCCCCGCAATCCTCACCCGCTTCGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806652.1
MGQATSTHGHNPGEPSADNQEQDFTSAIPDGCLALIFQRLSYDDRNNCLLVCRRWLVVEGQNRRRLALNASSRVTIRLPAILTRFDSITELALHCNRNSVSINDHALILISQRCHNLARLKLRRCREVSGVGILALAQNCKSLRKFSCTSCTFGDKGMASLLNNCSSLQELSVKRLRGIKDGEPISPGVAASSLRSIKLKKLYNGHCFCSLVTESKNLTTLKILSCTGNWDGLLHDVARRNNFLKEIHLEKVQVSDVGLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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