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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002339`

染色体: Chr04 坐标: 37733498-37735638 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002339`
名称	SmilChr04G002339
描述	protein RER1A-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37733498 - 37735638 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021476`
GeneID	`131021476`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021476`
原始查询	`SmilChr04G002339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RER1A-like
产物	protein RER1A-like
Arabidopsis	`AT4G39220` (ATRER1A) Rer1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830077] identity=58.5; qcov=0.935; evalue=3.72e-80; confidence=high
Rice	`Os08g0309300` (Cen8.t00808) - identity=66.5; qcov=0.861; evalue=6.37e-78; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0006621 (protein retention in ER lumen); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum)
KEGG	-
Pfam	PF03248 (Rer1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021476

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057806655.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057806655.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057806656.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806655.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806655.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37733711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C80,D11
`Chr4:37733732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr4:37734996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806655.1

205 aa

102

205

Rer1

PF03248 Rer1 29-184 aa

XP_057806656.1

201 aa

100

201

Rer1

PF03248 Rer1 29-187 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806655.1`	Pfam	`PF03248`	Rer1	Family	29	184	3.8e-67	226.0	Rer1 family
`XP_057806656.1`	Pfam	`PF03248`	Rer1	Family	29	187	1.1e-68	231.0	Rer1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950673.1
TTTTCGTATAAAAGCATGTTTATACATCCTTTGCGTATGCAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAACCCTTGGCAGACTTGATATAGTAGCAGTAGTCTAACAATTATCACTAACCAAACGACAAACAATTGACAATGGAACCCAGCGCCGACGGTTCCACCACCACGACCACGGCGAGTCCCGCCCCGGCCTCTTCCGCCGCGGCCGCCATCTCGCAGTGGAAATTCGCGGTATCACAGCGGTTCCAGCACT...

XM_057950672.1
AAAGCATGTTTATACATCCTTTGCGTATGCAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAACCCTTGGCAGACTTGATATAGTAGCAGTAGTCTAACAATTATCACTAACCAAACGACAAACAATTGACAATGGAACCCAGCGCCGACGGTTCCACCACCACGACCACGGCGAGTCCCGCCCCGGCCTCTTCCGCCGCGGCCGCCATCTCGCAGTGGAAATTCGCGGTATCACAGCGGTTCCAGCACTTCCTAGACAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021476
ATGGAACCCAGCGCCGACGGTTCCACCACCACGACCACGGCGAGTCCCGCCCCGGCCTCTTCCGCCGCGGCCGCCATCTCGCAGTGGAAATTCGCGGTATCACAGCGGTTCCAGCACTTCCTAGACAAGTCAACACCGTACTTGCTCTACCGTTGGATCGCGTTTCTCTGCATCGCATTGATCTATGGAGTCCGGGTGTACCTGGTCCAGGGATTCTACGTGGTTTCTTATGCCCTCGGCATCTACTTGCTCAATTTGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806655.1
MEPSADGSTTTTTASPAPASSAAAAISQWKFAVSQRFQHFLDKSTPYLLYRWIAFLCIALIYGVRVYLVQGFYVVSYALGIYLLNLFVGFLSPQDDPEFDATLPIRSSEEFRPFVRRLPEFKFWYSITKAFCIAFVLTFFSVFDVPVFWPILLFYWVMLCTLMLRRQILHMMKYKYVPFTFGKQVICKCHCLHFLHCLRCLLSST

XP_057806656.1
MEPSADGSTTTTTASPAPASSAAAAISQWKFAVSQRFQHFLDKSTPYLLYRWIAFLCIALIYGVRVYLVQGFYVVSYALGIYLLNLFVGFLSPQDDPEFDATLPIRSSEEFRPFVRRLPEFKFWYSITKAFCIAFVLTFFSVFDVPVFWPILLFYWVMLCTLMLRRQILHMMKYKYVPFTFGKQRYSGKRESSPERESLHP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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