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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002340`

染色体: Chr04 坐标: 37738163-37739696 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002340`
名称	SmilChr04G002340
描述	cysteine proteinase mucunain-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37738163 - 37739696 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021477`
GeneID	`131021477`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021477`
原始查询	`SmilChr04G002340`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine proteinase mucunain-like
产物	cysteine proteinase mucunain-like
Arabidopsis	`AT5G43060` (RD21B) Granulin repeat cysteine protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834321] identity=67.6; qcov=0.942; evalue=6.53e-162; confidence=high
Rice	`Os04g0670200` - identity=63.5; qcov=0.933; evalue=5.58e-146; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0005615 (GO:0005615); GO:0005764 (lysosome); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	-
Pfam	PF00112 (Peptidase_C1); PF08246 (Inhibitor_I29)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021477

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057806657.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806657.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806657.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806657.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806657.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37738415`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	69	A1,A10,A11,A19,A2,A5,A7,A8,A9,B101,B102,B105,B108,B109,B111,B117,B12,B121,B124,B127,B129,B132,B18,B2,B20,B25,B27,B29,B34,B4,B42,B43,B45,B47,B54,B55,B56,B60,B61,B68,B69,B7,B72,B79,B8,B81,B83,B96,B98,C14,C18,C20,C29,C38,C44,C48,C5,C56,C59,C6,C67,C7,C72,C73,C75,C83,D11,D2,D8
`Chr4:37738432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C50,D4
`Chr4:37738550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C62,D3
`Chr4:37738590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:37738761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:37738871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B59,B76,C49
`Chr4:37739277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,B66
`Chr4:37739310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr4:37739484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B60
`Chr4:37739561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806657.1

344 aa

172

344

Inhibitor_I29

Peptidase_C1

PF08246 Inhibitor_I29 33-89 aa PF00112 Peptidase_C1 122-336 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806657.1`	Pfam	`PF08246`	Inhibitor_I29	Domain	33	89	3.4e-19	69.6	Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)
`XP_057806657.1`	Pfam	`PF00112`	Peptidase_C1	Domain	122	336	2.6e-86	290.0	Papain family cysteine protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950674.1
CGCATCTCCATCCTCTTCAAGCCTAAGCAACAAACAAACCTCATCTCATCAACTAGCATCCCAGCTTGAGCTTGTCTCCCTTCCTCAGCCATGCCAATGCTCATCGCGGCCCTTTTCATCTTCAGCTTGGCCGCTGCTTCAACCACGCAAGCAACAGTGCGAAGCGACGAGCAGGTGAAGGGGCTGTACGAGGAGTGGTTGGCGAGGCACGGCAAAGCGTACAACGGAATCGGAGAGAAGGACAGAAGGTTCGACGTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021477
ATGCCAATGCTCATCGCGGCCCTTTTCATCTTCAGCTTGGCCGCTGCTTCAACCACGCAAGCAACAGTGCGAAGCGACGAGCAGGTGAAGGGGCTGTACGAGGAGTGGTTGGCGAGGCACGGCAAAGCGTACAACGGAATCGGAGAGAAGGACAGAAGGTTCGACGTGTTTAAGGATAACTTGAAGTTCATCGACGAACACAACACGGCGAACCGGAGCTACAAGGTGGGTTTGAACCAGTTTGCCGATCTCACTAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806657.1
MPMLIAALFIFSLAAASTTQATVRSDEQVKGLYEEWLARHGKAYNGIGEKDRRFDVFKDNLKFIDEHNTANRSYKVGLNQFADLTNDEYRSIYLATRIDAQRRFVKSKNASPRYLFRAGDRLPESVDWRKRGAVAPIKNQGTCGSCWAFSSVAAVEAINKIVTGEMITLSEQELVDCDRTQNAGCNGGLMDYAFQFIISNGGIDTEDDYPYRGVDAQCDLNRRNSKVVSIDGYEDVPKNEKALQKAVAHQPVSVAIEASG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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