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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002341`

染色体: Chr04 坐标: 37763061-37768442 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002341`
名称	SmilChr04G002341
描述	uncharacterized SmilChr04G002341
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37763061 - 37768442 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021478`
GeneID	`131021478`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021478`
原始查询	`SmilChr04G002341`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FMN-linked oxidoreductases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836857]; symbol=AT5G67220; hit=AT5G67220; species=arabidopsis; confidence=high
产物	FMN-linked oxidoreductases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836857]; symbol=AT5G67220; hit=AT5G67220; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G67220` (AT5G67220) FMN-linked oxidoreductases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836857] identity=71.8; qcov=0.925; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0712900` - identity=65.5; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008033 (tRNA processing); GO:0017150 (tRNA dihydrouridine synthase activity); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	-
Pfam	PF01207 (Dus)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021478

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057806658.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057806658.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806658.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806658.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806658.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37763425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:37767432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:37767528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:37767688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C44
`Chr4:37767842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B91,C34
`Chr4:37767984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,B66
`Chr4:37768072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806658.1

426 aa

213

426

Dus

PF01207 Dus 101-388 aa

XP_057806659.1

426 aa

213

426

Dus

PF01207 Dus 101-388 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806658.1`	Pfam	`PF01207`	Dus	Domain	101	388	4.8e-73	246.7	Dihydrouridine synthase (Dus)
`XP_057806659.1`	Pfam	`PF01207`	Dus	Domain	101	388	5.2e-74	249.9	Dihydrouridine synthase (Dus)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950676.1
ACAGGCCCTAAAGGTCTAAAACCCTAATTACTTATTTCCCCCAAAATAAAGCAGCACCACGCTGTTCAGGCAACCCACGAACCATACGCCTTCCGCCATGGCCCAAACCTCCGCTACCGTAACCTCCTTCCGCCAATGAGATTCCGACAACTTCTCTCTGCGTCTCTATTCACGCTTCACCCCAACTGTAAACTATCAAATACCCTTTTCAACCCATTAATGGCTACACAAACCCTAAACTTATCCTCAACGTCTACACC...

XM_057950675.1
AGGCCCTAAAGGTCTAAAACCCTAATTACTTATTTCCCCCAAAATAAAGCAGCACCACGCTGTTCAGGCAACCCACGAACCATACGCCTTCCGCCATGGCCCAAACCTCCGCTACCGTAACCTCCTTCCGCCAATGAGATTCCGACAACTTCTCTCTGCGTCTCTATTCACGCTTCACCCCAACTGTAAACTATCAAATACCCTTTTCAACCCATTAATGGCTACACAAACCCTAAACTTATCCTCAACGTCTACACCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021478
ATGAGATTCCGACAACTTCTCTCTGCGTCTCTATTCACGCTTCACCCCAACTGTAAACTATCAAATACCCTTTTCAACCCATTAATGGCTACACAAACCCTAAACTTATCCTCAACGTCTACACCGACTAACGGCGACGACACAAACGACGACGCCCTCTGCTCCTCCGAAATCACTACTCCGCCGCCGTCCGAGCCGCTCGGCGCCGCTTTGGACCGGCCGAATGGATGCCTGACCGGAGAAGCCCGCATCGAGCGGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806658.1
MRFRQLLSASLFTLHPNCKLSNTLFNPLMATQTLNLSSTSTPTNGDDTNDDALCSSEITTPPPSEPLGAALDRPNGCLTGEARIERAWAHWNGLGRPKFIVAPMVDNSELPFRLLCRKYGAQAAYTPMLHSRIFSENEKYRSQEFSTCKAYRPLFVQFCANDPDLLLEAARKVEAYCDYVDINFGCPQRIAKRGYYGAFLMDNLPLVKSLVEKLANGLNVPVSCKIRIFPDLQDTINYAKMLEEAGCALLAVHGRTRDEK...

XP_057806659.1
MRFRQLLSASLFTLHPNCKLSNTLFNPLMATQTLNLSSTSTPTNGDDTNDDALCSSEITTPPPSEPLGAALDRPNGCLTGEARIERAWAHWNGLGRPKFIVAPMVDNSELPFRLLCRKYGAQAAYTPMLHSRIFSENEKYRSQEFSTCKEDRPLFVQFCANDPDLLLEAARKVEAYCDYVDINFGCPQRIAKRGYYGAFLMDNLPLVKSLVEKLANGLNVPVSCKIRIFPDLQDTINYAKMLEEAGCALLAVHGRTRDEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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