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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002364`

染色体: Chr04 坐标: 38126193-38127457 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002364`
名称	SmilChr04G002364
描述	protein disulfide isomerase-like 2-2
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38126193 - 38127457 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023401`
GeneID	`131023401`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023401`
原始查询	`SmilChr04G002364`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein disulfide isomerase-like 2-2
产物	protein disulfide isomerase-like 2-2
Arabidopsis	`AT2G47470` (UNE5) thioredoxin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819360] identity=76.4; qcov=0.567; evalue=4.37e-32; confidence=medium
Rice	`Os01g0339900` (PDIL2) - identity=74; qcov=0.575; evalue=1.32e-32; confidence=medium
GO	GO:0003756 (protein disulfide isomerase activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006457 (protein folding)
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023401

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057808925.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057808925.1`
3	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.40000	`XP_057808925.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808925.1`
5	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057808925.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38126312`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	94	A11,A14,A15,A2,A23,A5,A7,A8,A9,B10,B100,B102,B105,B107,B108,B110,B111,B114,B117,B119,B12,B125,B127,B130,B132,B134,B138,B18,B19,B2,B22,B25,B28,B29,B31,B33,B34,B36,B38,B39,B4,B40,B45,B54,B55,B56,B58,B6,B60,B61,B62,B64,B68,B69,B77,B81,B83,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B98,C13,C14,C16,C18,C20,C21,C23,C29,C30,C34,C38,C40,C45,C5,C56,C59,C63,C67,C7,C72,C73,C80,C81,C84,C87,D10,D11,D2,D8
`Chr4:38126318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B76,C81
`Chr4:38126377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C24
`Chr4:38126396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:38127037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:38127099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr4:38127120`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C6
`Chr4:38127120`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C6
`Chr4:38127377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B25,B78,C2,C44
`Chr4:38127379`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A4,A9,B105,B78,C19,C30,C31,C35,C45,C46,C53,C74
`Chr4:38127415`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A22,B117,C49
`Chr4:38127415`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A22,B117,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808925.1

127 aa

127

Thioredoxin

PF00085 Thioredoxin 55-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808925.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	55	120	2.5e-11	44.2	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952942.1
ATGGATTTGATGGTGGAATTGGAGGATAAGGGGCGGCAAAACCGCAAACTTGTAGTAGCGCATCACCAGAGGCGAAGAGGGAGATCGAAGTTCGTAGTTGCTCAAAATGCAAGAGGCATTGTGGCTCCATCAGAAGATAGTTTGATAGAGGGTAAAATTATCTATGAAAAGGTTGCAACTGCATTTAATCTGGAGAAAGATGTGGTCATCGCTAATCTTGATGCTGATGCGCACAAGGATCTTGCAGAAAAGTATGGTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023401
ATGGATTTGATGGTGGAATTGGAGGATAAGGGGCGGCAAAACCGCAAACTTGTAGTAGCGCATCACCAGAGGCGAAGAGGGAGATCGAAGTTCGTAGTTGCTCAAAATGCAAGAGGCATTGTGGCTCCATCAGAAGATAGTTTGATAGAGGGTAAAATTATCTATGAAAAGGTTGCAACTGCATTTAATCTGGAGAAAGATGTGGTCATCGCTAATCTTGATGCTGATGCGCACAAGGATCTTGCAGAAAAGTATGGTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808925.1
MDLMVELEDKGRQNRKLVVAHHQRRRGRSKFVVAQNARGIVAPSEDSLIEGKIIYEKVATAFNLEKDVVIANLDADAHKDLAEKYGISYFPTLKFFPKNNKAGEDYDGDRDLDNFVTFINEKCRQSY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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