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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002372`

染色体: Chr04 坐标: 38222187-38234717 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002372`
名称	SmilChr04G002372
描述	dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38222187 - 38234717 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021506`
GeneID	`131021506`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021506`
原始查询	`SmilChr04G002372`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A
产物	dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A
Arabidopsis	`AT5G19690` (STT3A) staurosporin and temperature sensitive 3-like A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832089] identity=84.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0519900` - identity=81.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004576 (oligosaccharyl transferase activity); GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00513 (Various types of N-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02516 (STT3); PF21436 (STT3-PglB_core)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021506

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057806703.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057806703.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806703.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806703.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806703.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38222376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B47,B53
`Chr4:38225770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C45
`Chr4:38229964`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B140,B24,C34
`Chr4:38229964`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B140,B24,C34
`Chr4:38230518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B62
`Chr4:38230603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C34
`Chr4:38230648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr4:38234392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C21,C29,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806703.1

775 aa

388

775

STT3

STT3-PglB_core

PF02516 STT3 20-422 aa PF21436 STT3-PglB_core 571-630 aa

XP_057806704.1

774 aa

387

774

STT3

STT3-PglB_core

PF02516 STT3 20-422 aa PF21436 STT3-PglB_core 571-630 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806703.1`	Pfam	`PF02516`	STT3	Domain	20	422	9.2e-101	339.0	Oligosaccharyl transferase STT3, N-terminal
`XP_057806703.1`	Pfam	`PF21436`	STT3-PglB_core	Domain	571	630	0.00013	23.1	STT3/PglB/AglB core domain
`XP_057806704.1`	Pfam	`PF02516`	STT3	Domain	20	422	9e-101	339.0	Oligosaccharyl transferase STT3, N-terminal
`XP_057806704.1`	Pfam	`PF21436`	STT3-PglB_core	Domain	571	630	0.00013	23.2	STT3/PglB/AglB core domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950720.1
ACGAAAAAAATGATGGAAAACTAGATATTTTATTTGATGAGGTCATATTTGTCTTTTCGTGAACCGGCCTCCCCAAGGAGGAGTCCTGTGTTAAAGTCAAGTCTACTACTACAGAACCCGCCTTCAGTCTCATTCTCACACTCAGTGTGTGTAGCTTGAATCAACGGAGTCGATGGCGGCCCAGGAGACCTCTCAATCCGCGACTTTCCGCTACGCATTCGGGAATGTGCTTTCCTTTTCCGTTCTGTTACTGATCGGCG...

XM_057950721.1
ACGAAAAAAATGATGGAAAACTAGATATTTTATTTGATGAGGTCATATTTGTCTTTTCGTGAACCGGCCTCCCCAAGGAGGAGTCCTGTGTTAAAGTCAAGTCTACTACTACAGAACCCGCCTTCAGTCTCATTCTCACACTCAGTGTGTGTAGCTTGAATCAACGGAGTCGATGGCGGCCCAGGAGACCTCTCAATCCGCGACTTTCCGCTACGCATTCGGGAATGTGCTTTCCTTTTCCGTTCTGTTACTGATCGGCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021506
ATGGCGGCCCAGGAGACCTCTCAATCCGCGACTTTCCGCTACGCATTCGGGAATGTGCTTTCCTTTTCCGTTCTGTTACTGATCGGCGTTATGGCTTTCTCGATCCGTCTATTCTCAGTGATAAAGTATGAGAGTGTAATTCATGAATTCGATCCTTATTTCAATTACAGAGTGACACAGTTTCTTACAAAAAGTGGAGTATATGACTTCTGGAATTGGTTTGACGACCGAACATGGTATCCTCTTGGACGTGTGATTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806703.1
MAAQETSQSATFRYAFGNVLSFSVLLLIGVMAFSIRLFSVIKYESVIHEFDPYFNYRVTQFLTKSGVYDFWNWFDDRTWYPLGRVIGGTVYPGLTLTAGALWRILNSVNIPLSVETVCVFTAPVFSAFASWATYLLTKEIKGPGAGLTAAALLAMVPSYISRSVAGSYDNEAVAIFALIFTFYLYIKTLNTGSLFYATLNAIAYFYMVCSWGGYTFIINLIPMHVLLCIVTGRYSPRLYIAYAPLVVLGTLLAALVPVVG...

XP_057806704.1
MAAQETSQSATFRYAFGNVLSFSVLLLIGVMAFSIRLFSVIKYESVIHEFDPYFNYRVTQFLTKSGVYDFWNWFDDRTWYPLGRVIGGTVYPGLTLTAGALWRILNSVNIPLSVETVCVFTAPVFSAFASWATYLLTKEIKGPGAGLTAAALLAMVPSYISRSVAGSYDNEAVAIFALIFTFYLYIKTLNTGSLFYATLNAIAYFYMVCSWGGYTFIINLIPMHVLLCIVTGRYSPRLYIAYAPLVVLGTLLAALVPVVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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