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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002384`

染色体: Chr04 坐标: 38377682-38379518 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002384`
名称	SmilChr04G002384
描述	xyloglucan galactosyltransferase XLT2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38377682 - 38379518 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021517`
GeneID	`131021517`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021517`
原始查询	`SmilChr04G002384`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	xyloglucan galactosyltransferase XLT2-like
产物	xyloglucan galactosyltransferase XLT2-like
Arabidopsis	`AT5G62220` (GT18) glycosyltransferase 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836343] identity=54; qcov=0.806; evalue=1.34e-163; confidence=high
Rice	`Os04g0574100` - identity=43; qcov=0.901; evalue=4.01e-125; confidence=medium
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0008378 (galactosyltransferase activity); GO:0009969 (xyloglucan biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF03016 (Exostosin_GT47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021517

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057806729.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057806729.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806729.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806729.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38377951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:38377997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81
`Chr4:38378054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr4:38378108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr4:38378112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B42,B43
`Chr4:38378203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:38378270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,C11,C23,C69
`Chr4:38378309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:38378315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C3
`Chr4:38378335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B1,B101,B131,C35
`Chr4:38378383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,C59,C84
`Chr4:38378509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806729.1

496 aa

248

496

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 95-433 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806729.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	95	433	5.4e-60	203.9	Exostosin GT47 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950746.1
TTGGAGCTTAATAATATGCATGAGTAAATGTAATCCGTTTCACAATCCCATGCTATCCGTCAATCAACCCAAGCAGATTTTGCTGAAAAAGTCATTATATCAAAAATCAAAATCATAGACCCGGACCATTTTCCTGCCATATTTCTAATTGCACAATACTCAAAATTGAATTTCCTAAAATGTTCACATTTCAATTACCCACCACCTCCTCATTTCAACTAGAGAATTCTTCTCCAAAACCAAATCTTCAACCTTCAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021517
ATGTTCACATTTCAATTACCCACCACCTCCTCATTTCAACTAGAGAATTCTTCTCCAAAACCAAATCTTCAACCTTCAATTATGCTCCACGCATACTCGCCGGGGCGGAAGAAATCACATAAACCCCTCAATTTGTTGTACGCCCACATTTCATCGCACCCTTATTTATGGATCTCACTCGCCTTCCTCTTGATCCCTCTTTTCATCATCTCCGCCGCCCGCATTTCCCCGCCGTGTTTGCCCAACCGCACCGCCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806729.1
MFTFQLPTTSSFQLENSSPKPNLQPSIMLHAYSPGRKKSHKPLNLLYAHISSHPYLWISLAFLLIPLFIISAARISPPCLPNRTAAAVSGSEECPLGRVYAYDLPSTFNRDLLVHNCTDLDPWNWQCGIATNHGLGGPAAELRRVLPENISKSWFRTNQFALELIFHQRILRHKCRTAEPESAAAFYIPFYAGLAVGKYLWINDTAKRDRHCEMLLRWVQRQGHWHKSNGSDHFTAVGRITWDFRRLTDPGQIWGSTFLN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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