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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002386`

染色体: Chr04 坐标: 38396918-38399573 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002386`
名称	SmilChr04G002386
描述	peamaclein-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38396918 - 38399573 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021519`
GeneID	`131021519`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021519`
原始查询	`SmilChr04G002386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peamaclein-like
产物	peamaclein-like
Arabidopsis	`AT5G59845` (AT5G59845) Gibberellin-regulated family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836106] identity=53.3; qcov=1.01; evalue=4.29e-28; confidence=medium
Rice	`Os03g0760800` (GASR1) - identity=57.6; qcov=0.648; evalue=7.55e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02704 (GASA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021519

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057806731.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806731.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806731.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806731.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806731.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38397084`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B35
`Chr4:38397084`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B35
`Chr4:38397163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr4:38399409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr4:38399437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C3
`Chr4:38399489`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B107,B130,B59,B63,B86,B91,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806731.1

91 aa

GASA

PF02704 GASA 33-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806731.1`	Pfam	`PF02704`	GASA	Family	33	91	1.7e-21	76.8	Gibberellin regulated protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950748.1
GAGCTAAGCCATCAGTCTTCGTCTTCCCTCTCTAGAGTCTATCAACCTATACAACATTTACTTTGTTTCTTAGCTTACGCAAAATGAAGATTCTCATCTTCACTTTGTTTCTTTTGAGCTCTTCTTTTCTTGTGGACGCTGTTGCACCCCCGCTCGCACCAGTCCCCGACGCAGGTTCTTGCGACGCGATGTGTAACGCAAGGTGCGCGAAAGCAGGAATTTATAAGCGTTGCTTCAGGTATTGCGGTATGTGCTGCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021519
ATGAAGATTCTCATCTTCACTTTGTTTCTTTTGAGCTCTTCTTTTCTTGTGGACGCTGTTGCACCCCCGCTCGCACCAGTCCCCGACGCAGGTTCTTGCGACGCGATGTGTAACGCAAGGTGCGCGAAAGCAGGAATTTATAAGCGTTGCTTCAGGTATTGCGGTATGTGCTGCAACAAGTGCAAATGCGTTCCTTCTGGAACCTACGGGAACAAATCAGAGTGCCCATGCTACAGAGATATGCTTAACGCCAAGGGTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806731.1
MKILIFTLFLLSSSFLVDAVAPPLAPVPDAGSCDAMCNARCAKAGIYKRCFRYCGMCCNKCKCVPSGTYGNKSECPCYRDMLNAKGQSKCP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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