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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002392`

染色体: Chr04 坐标: 38427790-38430612 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002392`
名称	SmilChr04G002392
描述	molybdenum cofactor sulfurase-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38427790 - 38430612 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023407`
GeneID	`131023407`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023407`
原始查询	`SmilChr04G002392`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	molybdenum cofactor sulfurase-like
产物	molybdenum cofactor sulfurase-like
Arabidopsis	`AT1G16540` (ABA3) molybdenum cofactor sulfurase (LOS5) (ABA3) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838224] identity=71; qcov=0.669; evalue=1.25e-37; confidence=medium
Rice	`Os06g0670000` (MCSU3) - identity=50.8; qcov=0.906; evalue=3.76e-34; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00266 (Aminotran_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023407

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808931.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057808931.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057808931.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808931.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808931.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38427850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr4:38428063`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A10,A14,A6,B102,B105,B109,B118,B123,B128,B131,B134,B18,B26,B34,B36,B5,B50,B53,B57,B58,B6,B69,B7,B70,B72,B80,B82,B97,B98,C20,C24,C27,C33,C41,C42,C49,C50,C61,C67,C68,C72,D2
`Chr4:38428091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C12,C23,C26,C4
`Chr4:38428111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B129,B25,B39,B77
`Chr4:38428460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B40,C36,C67
`Chr4:38428461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:38428490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr4:38428518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B79,C82
`Chr4:38428520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B76,C18,C29
`Chr4:38428521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr4:38428547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:38429031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808931.1

139 aa

139

Aminotran_5

PF00266 Aminotran_5 85-133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808931.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	85	133	3.8e-07	30.1	Aminotransferase class-V

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952948.1
TGAACCGTTATGTATAAGAGTCATTTACAACGGTTTTTGAACCGTTATGTATGAGCGTCTCTAAAAACTGTTATGTATAATTTTTTTTATTAATTTTTTTAAAATAATTTTCTACATTCTTATATTATATTAAAAAATAACAAATAAATTATTTATCCTAAAATTTGAATTTATTCCTAGATATAGACTTTGAAAAATAAAAAATTCATAACATTTTTTTTATTTTATCAACACTTATATAAAATGTAAATTAAAAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023407
ATGATCTTGCTCTACAGATATGGTATGTATAATTTAAGAGTAAAGAGATGTCGAAAGTCAACAGCTTGTTTCTGGAGAAAGGGTTGTGGGAATTTTGTATTATGTGATGCAAACTTGCTAGGTGAGACGTACAATTTATTTGCATTTCCATCGGAGTGTAACTTCTCAGGTCTTAGATTCAACCTTGACCTGGTTAATTCCATAAAGGAAGGTTCTTATCAAATGCCCGGAACTTCTCCAACTCAGAGTGGTCACTGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808931.1
MILLYRYGMYNLRVKRCRKSTACFWRKGCGNFVLCDANLLGETYNLFAFPSECNFSGLRFNLDLVNSIKEGSYQMPGTSPTQSGHWMVLIDAAKGSSTCPPDLSKYKADFVVVSFYKLFGYPTGIGALIARNGRLVFLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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