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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002393`

染色体: Chr04 坐标: 38442411-38444838 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002393`
名称	SmilChr04G002393
描述	lysine-rich arabinogalactan protein 18-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38442411 - 38444838 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021525`
GeneID	`131021525`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021525`
原始查询	`SmilChr04G002393`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysine-rich arabinogalactan protein 18-like
产物	lysine-rich arabinogalactan protein 18-like
Arabidopsis	`AT4G37450` (AGP18) arabinogalactan protein 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829900] identity=51.6; qcov=0.226; evalue=2.94e-11; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF30998 (Lys-rich_AGP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021525

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057806735.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806735.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806735.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806735.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806735.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38442700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B139,C18,C22
`Chr4:38444129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B135,B58,C37
`Chr4:38444157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C24
`Chr4:38444464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr4:38444604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:38444627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:38444669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B69
`Chr4:38444670`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	73	A11,A2,A23,A24,A8,A9,B101,B107,B108,B110,B111,B118,B12,B122,B124,B127,B13,B130,B135,B138,B18,B22,B25,B4,B41,B42,B43,B45,B47,B53,B54,B55,B56,B59,B6,B60,B62,B63,B69,B71,B77,B79,B86,B87,B93,B96,B98,C14,C16,C26,C32,C33,C38,C48,C5,C53,C58,C60,C61,C63,C67,C68,C72,C78,C79,C8,C80,C85,C87,D11,D2,D8,D9
`Chr4:38444680`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C59
`Chr4:38444680`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C59
`Chr4:38444682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr4:38444706`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B115,B122,B39,B48,C31,C32,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806735.1

274 aa

137

274

Lys-rich_AGP

PF30998 Lys-rich_AGP 58-273 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806735.1`	Pfam	`PF30998`	Lys-rich_AGP	Family	58	273	2.4e-36	126.5	Lysine-rich arabinogalactan protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950752.1
CCCACCCAAATGTCGACTCTCTCTCCCAATTCCCCTCTCTTTCCCTTCGCATATCTCTCCTTTATTTATATCACTCACTCTCTCACTCATCTCCACTGCACACTCTCATCTCCGCATCTCTCTCTCTCTCTCATCAAACACCATTCCGAATTTTTTCTCTCTCTAAAACCACCCATGGATAGAGGAACAGCAATACTACTGGCATTCATCTGCCTTGTGGCCAGCGTCGGCGGCGAGGCTCCCTCCGCCTCCCCAGCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021525
ATGTCGACTCTCTCTCCCAATTCCCCTCTCTTTCCCTTCGCATATCTCTCCTTTATTTATATCACTCACTCTCTCACTCATCTCCACTGCACACTCTCATCTCCGCATCTCTCTCTCTCTCTCATCAAACACCATTCCGAATTTTTTCTCTCTCTAAAACCACCCATGGATAGAGGAACAGCAATACTACTGGCATTCATCTGCCTTGTGGCCAGCGTCGGCGGCGAGGCTCCCTCCGCCTCCCCAGCCAAGGCCCCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806735.1
MSTLSPNSPLFPFAYLSFIYITHSLTHLHCTLSSPHLSLSLIKHHSEFFLSLKPPMDRGTAILLAFICLVASVGGEAPSASPAKAPTATKVSTPPAASPVATPPSKPTTPAPVATPPAAAPVSTPPAAAPVSTPPASPPVVTAPPAPVPVSSPPAPVPVSSPPAPVPVSSPPVPTPTASPPVVSSPPSPAPEAATPPTEAPVEAPSPSKKKSKKHAAPAPAPEMLGPPAPPAGAPGPSADAFAPGPGSVGDLSGAEKLMA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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