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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002395`

染色体: Chr04 坐标: 38471704-38473067 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002395`
名称	SmilChr04G002395
描述	probable esterase D14L
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38471704 - 38473067 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021527`
GeneID	`131021527`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021527`
原始查询	`SmilChr04G002395`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable esterase D14L
产物	probable esterase D14L
Arabidopsis	`AT4G37470` (KAI2) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829902] identity=68.3; qcov=0.974; evalue=2.04e-142; confidence=high
Rice	`Os11g0384789` (D14L) - identity=71.8; qcov=0.978; evalue=1.92e-143; confidence=high
GO	GO:0080167 (response to karrikin)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021527

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806737.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806737.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057806737.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806737.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806737.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38472026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B66,C10,C55
`Chr4:38472057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr4:38472062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:38472066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:38472093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B88
`Chr4:38472144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B60
`Chr4:38472261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B44,B7,C28
`Chr4:38472447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr4:38472494`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B37,B85,C50,C81,D6
`Chr4:38472494`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B37,B85,C50,C81,D6
`Chr4:38472504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr4:38472568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806737.1

272 aa

136

272

Abhydrolase_1

Abhydrolase_6

PF00561 Abhydrolase_1 20-253 aa PF12697 Abhydrolase_6 21-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806737.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	20	253	4e-18	66.7	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057806737.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	21	256	4.4e-14	54.3	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950754.1
AAAGTATTAAGATAGTGAATATTCAAGTGTTGTGGCAGTGGCACGCACAAACACAAACAAAATTCTCACGAGACCATTTATTTATGACTTTAATGTGAATGGATAGGCACCGCCTTCCCACTAGCGAGAGCTAGAGTCAAAACTTGTAGTCCACAAATTCCCAACTCAACTTTTCCACCACTCCACTTTCCAATGGGCGCCTCCGTCGCGGAAGCCCACAACGTCCGCGTCCTCGGCGGCGGCGACACCATCGTGGTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021527
ATGGGCGCCTCCGTCGCGGAAGCCCACAACGTCCGCGTCCTCGGCGGCGGCGACACCATCGTGGTCCTCGGGCACGGCTTCGGCACAGACCAGTCCGTGTGGAAGCACCTGCTTCCCCACCTGGTTGACTGCTACAAGGTCATCGTCTACGACCAGATGGGCGCCGGCACCACCAACCCCGACTACTTCGACTTCGACCGCTACTCCACTCTCGAGGGCTTCGCCTACGACCTCCTCGCCATCCTCGACGAGTTCAACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806737.1
MGASVAEAHNVRVLGGGDTIVVLGHGFGTDQSVWKHLLPHLVDCYKVIVYDQMGAGTTNPDYFDFDRYSTLEGFAYDLLAILDEFNVHKCIYVGHSLSSMAGAIASIFRPDRFHKLIMLSASPRFLNTADYLGGFEQEDIDQLCGAMETNYKSWASGFAPLVVGGDMESVAVQEFSRTLFNMRPDIALSMFRTIFTFDLRHFLERVTVPCHIIQSSKDLAVPVAVAEYLHQNLGGKSIVEVIPTEGHLPQLSAPDLTTPV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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