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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002396`

染色体: Chr04 坐标: 38476946-38483560 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002396`
名称	SmilChr04G002396
描述	casein kinase II subunit alpha-2
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38476946 - 38483560 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021528`
GeneID	`131021528`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021528`
原始查询	`SmilChr04G002396`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	casein kinase II subunit alpha-2
产物	casein kinase II subunit alpha-2
Arabidopsis	`AT5G67380` (CKA1) casein kinase alpha 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836873] identity=92.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0114400` (OsCKA2-2) - identity=94; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0005956 (protein kinase CK2 complex); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04712 (Circadian rhythm - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021528

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806738.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806738.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057806738.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057806738.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806738.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38478352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:38478354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr4:38479023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B31,B64,B65,C45
`Chr4:38480821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:38483135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C23,C69
`Chr4:38483139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr4:38483331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806738.1

333 aa

166

333

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 34-319 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 36-236 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806738.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	34	319	3.9e-63	214.0	Protein kinase domain
`XP_057806738.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	36	236	1.3e-18	68.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950755.1
AAAAACTCAAATAATTGTCTACACTTAAAAAATATAAAAAAAGAACTCGACTATTGTCGTGTCAAATGATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGTCCGACCAAAACTGAATTGGATCATCCCCAAATCAGAATTAATCTGTCGTTTCTTATCCTTTAATTTGATTTTTTTTTTGGACGAATCGAATCGAACTCATAATTTCAATATTTCTTCCCCCATTCCACACCTCCAAACACAAACCATACTGCAATTTCTTCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021528
ATGTCGAAAGCGCGGGTGTACGCGGACATTAACGTGCTGCGTCCCAGAGAATACTGGGATTACGAGAATCTCGCTGTCCAGTGGGGAGACCAGGATGATTATGAGGTTGTTCGCAAAGTCGGTAGGGGAAAATACAGTGAAGTTTTTGAAGGCATAAATGTGAATAGCAATGAAAGGTGCATAATCAAGATTCTGAAGCCTGTTAAGAAGAAAAAGATAAAGAGAGAGATCAAAATTCTGCAGAACCTATGTGGGGGACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806738.1
MSKARVYADINVLRPREYWDYENLAVQWGDQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNSNERCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLCGGPNVVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEFVNSTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNQDQLVKIAKVLGTDELNAYLHKYRLEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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