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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002400`

染色体: Chr04 坐标: 38552084-38552530 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002400`
名称	SmilChr04G002400
描述	uncharacterized SmilChr04G002400
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38552084 - 38552530 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023409`
GeneID	`131023409`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023409`
原始查询	`SmilChr04G002400`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=37.8; qcov=0.858; evalue=2.55e-14; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=48.8; qcov=0.581; evalue=8.34e-22; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023409

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808932.1`
2	Telomere	端粒	0.60000	`XP_057808932.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808932.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808932.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808932.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38552105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C21,C29,C59
`Chr4:38552109`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C11,C23,C69
`Chr4:38552109`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C11,C23,C69
`Chr4:38552112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B15,B74,C28
`Chr4:38552127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,C11,C23,C69
`Chr4:38552157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B59,C2,C81,C85
`Chr4:38552179`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A16,A19,A20,A7,B103,B106,B118,B126,B127,B133,B16,B21,B27,B34,B35,B37,B42,B43,B51,B55,B74,C12,C15,C17,C20,C22,C51,C54,C58,C62,C70,D1
`Chr4:38552236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B83,C21,C29,C59
`Chr4:38552236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C21,C29,C59
`Chr4:38552265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C23,C69
`Chr4:38552309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C18
`Chr4:38552313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,C11,C23,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808932.1

148 aa

148

DUF8418

PF28509 DUF8418 72-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808932.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	72	111	3.2e-22	78.7	Domain of unknown function (DUF8418)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952949.1
ATGTTTGTCAATGAAAACTCTTCAGTTGATTCAGACTCAAGTTCTGATGTTTCCCATTCCAACGAACTTGATGAATGGGAAGAACGAGTTTATCAACAAAATCGTCAATTTGATAACATCATCCTGAATATGATCCTAAATAATCATAATCTGATTGTAGTACATCAAATTCCAACAGCCAACGGGAGATATTGTGATAGGGAACGTGATTTTGGTGCAGAGCGTTTGATCAACGACTACTTCAGCGACACCCCAACGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023409
ATGTTTGTCAATGAAAACTCTTCAGTTGATTCAGACTCAAGTTCTGATGTTTCCCATTCCAACGAACTTGATGAATGGGAAGAACGAGTTTATCAACAAAATCGTCAATTTGATAACATCATCCTGAATATGATCCTAAATAATCATAATCTGATTGTAGTACATCAAATTCCAACAGCCAACGGGAGATATTGTGATAGGGAACGTGATTTTGGTGCAGAGCGTTTGATCAACGACTACTTCAGCGACACCCCAACGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808932.1
MFVNENSSVDSDSSSDVSHSNELDEWEERVYQQNRQFDNIILNMILNNHNLIVVHQIPTANGRYCDRERDFGAERLINDYFSDTPTYTPELFRRRFRMQKSLFIRIVEAVTTNDVFFQQRRDATGIVGLSSLQKCTGAMRVLAYGTSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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