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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002401`

染色体: Chr04 坐标: 38553610-38554477 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002401`
名称	SmilChr04G002401
描述	uncharacterized SmilChr04G002401
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38553610 - 38554477 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023410`
GeneID	`131023410`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023410`
原始查询	`SmilChr04G002401`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922]; symbol=AT3G47680; hit=AT3G47680; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922]; symbol=AT3G47680; hit=AT3G47680; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=28.1; qcov=1; evalue=1.9e-15; confidence=low
Rice	`Os02g0463725` - identity=37.7; qcov=0.419; evalue=2.21e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023410

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808934.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808934.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808934.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808934.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808934.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38553613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B71
`Chr4:38553624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,B69
`Chr4:38553640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B105
`Chr4:38553641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B105
`Chr4:38553698`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B85,C21,C29,C59
`Chr4:38553698`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B85,C21,C29,C59
`Chr4:38553742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr4:38553750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B105,D10
`Chr4:38553756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A16,B105
`Chr4:38553756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B105
`Chr4:38553777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B43,B64
`Chr4:38553783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952951.1
ATGGGTGTTCAACGCCCAAACAAAAATCAGAAAGGGGCAAAAAATGTAGCTTGGTGTGTGAAAGAAGATGTAGCCCTTATGTCATCTTGGATATATGCTAGCGAAGATAGCGTTCGAGGAAAAAATCAAAAGGGGGAATCGCTTTGGTCACGTGTTCATAAATTGTATCACAACACTCAAGCAGAAAATCCGAATGAGCTCAACGAACAAAACATTGAATCGATGAAAGGTCGCTGGAAACGTCTTAACGAAAATGTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023410
ATGGGTGTTCAACGCCCAAACAAAAATCAGAAAGGGGCAAAAAATGTAGCTTGGTGTGTGAAAGAAGATGTAGCCCTTATGTCATCTTGGATATATGCTAGCGAAGATAGCGTTCGAGGAAAAAATCAAAAGGGGGAATCGCTTTGGTCACGTGTTCATAAATTGTATCACAACACTCAAGCAGAAAATCCGAATGAGCTCAACGAACAAAACATTGAATCGATGAAAGGTCGCTGGAAACGTCTTAACGAAAATGTAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808934.1
MGVQRPNKNQKGAKNVAWCVKEDVALMSSWIYASEDSVRGKNQKGESLWSRVHKLYHNTQAENPNELNEQNIESMKGRWKRLNENVNKWVAACREANARRMSGMSDYDVEKKAQSIYEADVDDQQSGGSSKRSKTSEDGGFSIPSNPETPTSEQSTVTRPIGRDKAKTKEKCKVSQSESTHESAVVAEIRAMRLTSDAEAELIKTRIDLEREKLQRNTMKMKEKMLLQLLSKEHLSPEDEEMKRQLIKIVFGK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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