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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002423`

染色体: Chr04 坐标: 38871718-38873046 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002423`
名称	SmilChr04G002423
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38871718 - 38873046 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023417`
GeneID	`131023417`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023417`
原始查询	`SmilChr04G002423`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=32.2; qcov=0.831; evalue=2.38e-56; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=33.7; qcov=0.822; evalue=5.1e-54; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023417

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808940.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808940.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808940.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808940.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808940.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38871736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,C42,C61,D1
`Chr4:38871739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr4:38871759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:38872016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B4,B51,B89,C11,C19,C23,C46,C69,C86
`Chr4:38872039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr4:38872046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,C38,C70,D9
`Chr4:38872284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:38872410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B101,B114,B68
`Chr4:38872419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B75
`Chr4:38872604`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr4:38872604`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr4:38872624`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A14,A15,A7,B10,B19,B2,B27,B34,B38,B39,B40,B61,B9,C20,C40,C7,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808940.1

415 aa

208

415

MULE

SWIM

PF10551 MULE 3-40 aa PF04434 SWIM 239-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808940.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	3	40	2.6e-08	34.8	MULE transposase domain
`XP_057808940.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	239	258	5.3e-07	29.8	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952957.1
ATGTCAAGTAATGATCCTCCTGGTGTGATTATCACTGATCAGGATGCTGCCATTGCACGAGCTATCTTAGAGAAATTGCCTCGTACGTTGCATCGATTTTGTTTGTGGCACATCCTTAATAAATTTCCTGAAAAGATGAACTCTTTACTATACCACGAGCATTATCACAAGCTTGTACATATTATTAAGGAGTCAGAATCTGGTGAGGAATTTGAACATCGATGGATGGAGGTAATGGAATCTACAGAGTTGAAGAGTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023417
ATGTCAAGTAATGATCCTCCTGGTGTGATTATCACTGATCAGGATGCTGCCATTGCACGAGCTATCTTAGAGAAATTGCCTCGTACGTTGCATCGATTTTGTTTGTGGCACATCCTTAATAAATTTCCTGAAAAGATGAACTCTTTACTATACCACGAGCATTATCACAAGCTTGTACATATTATTAAGGAGTCAGAATCTGGTGAGGAATTTGAACATCGATGGATGGAGGTAATGGAATCTACAGAGTTGAAGAGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808940.1
MSSNDPPGVIITDQDAAIARAILEKLPRTLHRFCLWHILNKFPEKMNSLLYHEHYHKLVHIIKESESGEEFEHRWMEVMESTELKSNEWLSDLYTIRHRWVPTYVKDVFAAGISSSQRAESNHSFFKRYVNHKNSLIDFIMRFNRALVNQRHEELVANHTDINERPRLITGLLMENQMTSIYTKTIFLLFQKELQQSMLYLCTVLSSTDAYSKYKVKRFELGETFNRERELTYYTSSDSISCSCRLFEFEGYPCRHMLCW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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