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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002430`

染色体: Chr04 坐标: 38923688-38940900 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002430`
名称	SmilChr04G002430
描述	BTB/POZ domain-containing protein At3g49900
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38923688 - 38940900 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021556`
GeneID	`131021556`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021556`
原始查询	`SmilChr04G002430`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein At3g49900
产物	BTB/POZ domain-containing protein At3g49900
Arabidopsis	`AT3G49900` (AT3G49900) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824152] identity=44.7; qcov=1.09; evalue=1.36e-105; confidence=medium
Rice	`Os07g0587200` - identity=35.8; qcov=0.493; evalue=4.08e-32; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00651 (BTB); PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021556

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806772.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057806772.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057806772.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806772.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806772.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38928819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C86
`Chr4:38928823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C7
`Chr4:38928930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:38928970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:38929696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr4:38929810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B31,B64
`Chr4:38929845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B52
`Chr4:38930066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:38931867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:38931953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B52
`Chr4:38932028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:38932058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806772.1

420 aa

210

420

BTB

NPH3

PF00651 BTB 62-142 aa PF03000 NPH3 218-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806772.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	62	142	3.3e-08	34.4	BTB/POZ domain
`XP_057806772.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	218	276	3.5e-10	40.7	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950789.1
CCAAAAAATAGAAAATCCCTAAGACACATCAGAAACAACAACCCACGGTCCCCACCCATTTCTCTATTCGCCTCCAATAGCTGCTACAGTCGCCGCCAATGGCTATGGACGATGCGGCACTTTTGCGGAGAAGGCGAACGATTTCAGCTGTGGACTGTACAATCAGATAGAGACGGTGAAGGCGGAGGCCGGCGCCGCCTCCATAACTCTCGAGCAGACGTGCGCTCTCAACGAACAAAAATACGTTTCCCTTTCCGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021556
ATGGATTTGGGAATGAAGGGGTGGAATGAATTGGGGGTTGTTGGCACAATCTATGAAGAAGAAGATGAAAATTCTGCATTATCATCATCATTCTCCACTATTCCTTCCCTTGAATCTTCCCCTTCAAACACACCACAGCTCTCCAGGCAAGACCCACCATGGGCATCAGGAAGGAGGCATGATCCGGATGTGGTTATACATGTCCAGGGCTCATGTTTTCGCCTTCACAAGCAAGCATTGATAGCGAAGAGTGCCTATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806772.1
MDLGMKGWNELGVVGTIYEEEDENSALSSSFSTIPSLESSPSNTPQLSRQDPPWASGRRHDPDVVIHVQGSCFRLHKQALIAKSAYLKRQLAEFPEITLSPPLSITAQTFASVTEFCYGTHVAVTPFNVAALRTAAELLGMTGTGGAGGENLEEITEAYFRRVVAVNKECASIVLQSCFPLLPEAEVAACLVSRCIEALSLTASEADGDGSCLEGFKNVRMDDLKLILESVSQRLTDCHDLLYRIIDIYLKENIAWLSEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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