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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002439`

染色体: Chr04 坐标: 39076091-39078442 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002439`
名称	SmilChr04G002439
描述	uncharacterized SmilChr04G002439
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39076091 - 39078442 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021565`
GeneID	`131021565`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021565`
原始查询	`SmilChr04G002439`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333]; symbol=AT5G33406; hit=AT5G33406; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333]; symbol=AT5G33406; hit=AT5G33406; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G33406` (AT5G33406) hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333] identity=64.9; qcov=0.548; evalue=6.67e-174; confidence=medium
Rice	`Os09g0499600` - identity=39; qcov=0.809; evalue=8.36e-125; confidence=medium
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659); PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021565

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806798.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806798.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806798.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806798.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806798.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39076247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B58,C37
`Chr4:39076248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:39076281`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B92,C62
`Chr4:39076281`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B92,C62
`Chr4:39076306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B61
`Chr4:39076333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,D9
`Chr4:39076334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C33
`Chr4:39076335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,D9
`Chr4:39076336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr4:39076363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B16,B17
`Chr4:39076367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:39076372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806798.1

666 aa

333

666

DUF659

Dimer_Tnp_hAT

PF04937 DUF659 101-250 aa PF05699 Dimer_Tnp_hAT 478-542 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806798.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	101	250	1.5e-58	197.4	Domain of unknown function (DUF659)
`XP_057806798.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	478	542	1.1e-10	41.9	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950815.1
GTTGATGATCAAGAAGAGGATGAAGAGATGGAAATTGGAGGTAGCTCACGCACCATGACGAGGAAGAAGGCCCCTGCTCCAAAGAGGATGAAAGGTCCTTTAGATGTTTATCTTAGCCAACCTAGTTCTCAAACTCATGAAGTATTGAAGGGAAGAAAAGAAAGAAAAGGAGTCTTTGGTGCTAGTGACAAGTTATGTAGGGAAAGAGCTTGTAAAGCAATTGCAAGGTTCTTTTATGACAATGCTATTCCTTTCCATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021565
ATGGAAATTGGAGGTAGCTCACGCACCATGACGAGGAAGAAGGCCCCTGCTCCAAAGAGGATGAAAGGTCCTTTAGATGTTTATCTTAGCCAACCTAGTTCTCAAACTCATGAAGTATTGAAGGGAAGAAAAGAAAGAAAAGGAGTCTTTGGTGCTAGTGACAAGTTATGTAGGGAAAGAGCTTGTAAAGCAATTGCAAGGTTCTTTTATGACAATGCTATTCCTTTCCATCCGGCCACTAGTGATAGTTTCAAGAACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806798.1
MEIGGSSRTMTRKKAPAPKRMKGPLDVYLSQPSSQTHEVLKGRKERKGVFGASDKLCRERACKAIARFFYDNAIPFHPATSDSFKNMVEEIGQYGPGLEPPSMYELRVPFLQKEVEVTDTKVLEFKKEWATKGCSILSDGWRDSVVQKDIVNFLVNSPKGSVFIKSVEVSEVVKDAITLFQMLDSIVEEVGEANVVQVVTDNASNYVKAGKLLMTKRPHLYWTPCAAHCVDLMLEDIGKLPKIKNALKKAIFMNGYIYNH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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