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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002444`

染色体: Chr04 坐标: 39156815-39157807 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002444`
名称	SmilChr04G002444
描述	uncharacterized SmilChr04G002444
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39156815 - 39157807 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021570`
GeneID	`131021570`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021570`
原始查询	`SmilChr04G002444`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	VQ motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816819]; symbol=AT2G22880; hit=AT2G22880; species=arabidopsis; confidence=low
产物	VQ motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816819]; symbol=AT2G22880; hit=AT2G22880; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G22880` (AT2G22880) VQ motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816819] identity=36.1; qcov=0.747; evalue=1.2e-13; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05678 (VQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021570

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806803.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057806803.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806803.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806803.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806803.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39157256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81
`Chr4:39157288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806803.1

174 aa

174

PF05678 VQ 73-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806803.1`	Pfam	`PF05678`	VQ	Motif	73	96	2.4e-08	34.0	VQ motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950820.1
TTCAACTACAAGGTCTCTATCCCAATTTCCCTCAAACATTTGAATTCAAATTGTTACAATTGTTTAAGATATTAAATATATATACATCTCATCACGACTTTCTCTTCCGAGTTTAGTGTATATATATAATCGCAAAAAGTAGGAAACATAGCAAAAGCAAGATTTGATAATCATCATGGAGTCGTATTCGTCCATTAGCAACACAGACTCCTCTTCATCTGCTTCATATTCTTTCTCATCAAATTCCTCAACTCACTACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021570
ATGGAGTCGTATTCGTCCATTAGCAACACAGACTCCTCTTCATCTGCTTCATATTCTTTCTCATCAAATTCCTCAACTCACTACCTTTATAATCCCTGCCGCCAAGCAACGAAGAGCGCGAAACCTCAGCCGTCGTTCCGGTCGGCGCTCCACACCGTCCGCAAATCTCCGGCCAAGAACGTGATCACCAAGAAACCCATCGCTCCGCTGCCGCCGACACCACCGAGAATCTACAAGGTGGAGCCCATTGAATTCAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806803.1
MESYSSISNTDSSSSASYSFSSNSSTHYLYNPCRQATKSAKPQPSFRSALHTVRKSPAKNVITKKPIAPLPPTPPRIYKVEPIEFKDVVQKLTGAGELQSTRLREVAPPPLSLSPRFVPHSAENEEEKRQKSFDTSFGILSPLGFSLSPSSLAWCSAMLLSPGTLASFETSAVI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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