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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002446`

染色体: Chr04 坐标: 39163909-39167473 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002446`
名称	SmilChr04G002446
描述	thioredoxin-like protein AAED1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39163909 - 39167473 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021573`
GeneID	`131021573`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021573`
原始查询	`SmilChr04G002446`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin-like protein AAED1, chloroplastic
产物	thioredoxin-like protein AAED1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G65840` (AT5G65840) Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836713] identity=62.3; qcov=0.854; evalue=2.48e-92; confidence=high
Rice	`Os03g0729200` - identity=67.5; qcov=0.787; evalue=9.75e-92; confidence=high
GO	GO:0016209 (antioxidant activity)
KEGG	-
Pfam	PF00578 (AhpC-TSA); PF13911 (AhpC-TSA_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021573

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057806808.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057806808.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057806809.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806808.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806808.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39164212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:39164220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:39165772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B128,B33
`Chr4:39165772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B33
`Chr4:39165821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806808.1

254 aa

127

254

AhpC-TSA

AhpC-TSA_2

PF00578 AhpC-TSA 78-171 aa PF13911 AhpC-TSA_2 117-233 aa

XP_057806809.1

239 aa

120

239

AhpC-TSA_2

PF13911 AhpC-TSA_2 136-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806808.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	78	171	2.4e-06	28.2	AhpC/TSA family
`XP_057806808.1`	Pfam	`PF13911`	AhpC-TSA_2	Domain	117	233	3.9e-19	69.8	AhpC/TSA antioxidant enzyme
`XP_057806809.1`	Pfam	`PF13911`	AhpC-TSA_2	Domain	136	218	5.4e-12	46.8	AhpC/TSA antioxidant enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950826.1
GTCAGCTTCCCAACCGTTACGGGGGAAATATACCAACCAGACTTTGAGCTGAATCCTAACCAAGCATGGCGAAAATCATATCTCCACGAATTCTAACTCCGTCCACTTCCCTTCTTCCCCTCCCTCTAAAATCACTATTCCCTTCCCAATCTTTAGCTATCTCAACTAAGCCCATAATCACACCTCGTTTCCGACGGAAACCAAATAGGCCGTCGCTCATGGCCAGGGCGTCGTCCACCGCCGCCGCCGTCGTGCCCGAT...

XM_057950825.1
ATGGCGAAAATCATATCTCCACGAATTCTAACTCCGTCCACTTCCCTTCTTCCCCTCCCTCTAAAATCACTATTCCCTTCCCAATCTTTAGCTATCTCAACTAAGCCCATAATCACACCTCGTTTCCGACGGAAACCAAATAGGCCGTCGCTCATGGCCAGGGCGTCGTCCACCGCCGCCGCCGTCGTGCCCGATGACATATCGGATGTGCTCGGAGAAGTCAGTATCTTCACCGCCGCCGGAGAGCCCGTGCAATTGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021573
ATGGCGAAAATCATATCTCCACGAATTCTAACTCCGTCCACTTCCCTTCTTCCCCTCCCTCTAAAATCACTATTCCCTTCCCAATCTTTAGCTATCTCAACTAAGCCCATAATCACACCTCGTTTCCGACGGAAACCAAATAGGCCGTCGCTCATGGCCAGGGCGTCGTCCACCGCCGCCGCCGTCGTGCCCGATGACATATCGGATGTGCTCGGAGAAGTCAGTATCTTCACCGCCGCCGGAGAGCCCGTGCAATTGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806808.1
MAKIISPRILTPSTSLLPLPLKSLFPSQSLAISTKPIITPRFRRKPNRPSLMARASSTAAAVVPDDISDVLGEVSIFTAAGEPVQLKDLWDQQEGIAVVALLRHFGCFCCWELAASLKEAKEKLDSAGVKLIAVGVGTPDKAKLLGERLPFPMDSLYADPDRKAYDVLGLYYGFRRTFLNPASIKVFSRYEELKKAMKNYTIRATPDDTSSVLQQGGMFVFKGKQLLYARKDEGTGDHAPLDEILDICCKVPTP

XP_057806809.1
MAKIISPRILTPSTSLLPLPLKSLFPSQSLAISTKPIITPRFRRKPNRPSLMARASSTAAAVVPDDISDVLGEVSIFTAAGEPVQLKDLWDQQEGIAVVALLRHFGCFCCWELAASLKEAKEKLDSAGVKLIALPFPMDSLYADPDRKAYDVLGLYYGFRRTFLNPASIKVFSRYEELKKAMKNYTIRATPDDTSSVLQQGGMFVFKGKQLLYARKDEGTGDHAPLDEILDICCKVPTP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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