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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002448`

染色体: Chr04 坐标: 39195107-39196185 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002448`
名称	SmilChr04G002448
描述	short-chain dehydrogenase ptmH-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39195107 - 39196185 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021575`
GeneID	`131021575`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021575`
原始查询	`SmilChr04G002448`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	short-chain dehydrogenase ptmH-like
产物	short-chain dehydrogenase ptmH-like
Arabidopsis	`AT5G65205` (AT5G65205) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836644] identity=40.3; qcov=0.929; evalue=1.01e-71; confidence=medium
Rice	`Os12g0633800` - identity=62.2; qcov=0.629; evalue=3.96e-72; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021575

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057806815.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057806815.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057806815.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806815.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806815.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39195195`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	60	A2,A23,A24,A9,B101,B108,B110,B111,B118,B12,B127,B135,B22,B24,B25,B28,B33,B4,B45,B51,B55,B56,B6,B60,B69,B71,B75,B77,B87,B89,B91,B93,B95,B96,B98,C11,C19,C23,C26,C33,C34,C38,C46,C47,C5,C58,C59,C67,C69,C72,C77,C78,C84,C85,C86,D10,D2,D6,D8,D9
`Chr4:39195731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr4:39195747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:39195762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr4:39195918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:39195935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806815.1

294 aa

147

294

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 19-204 aa PF13561 adh_short_C2 28-204 aa PF08659 KR 50-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806815.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	19	204	9.9e-43	146.6	short chain dehydrogenase
`XP_057806815.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	28	204	7.3e-31	108.3	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase
`XP_057806815.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	50	188	3.2e-06	27.9	KR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950832.1
TAGTCGCCGAATATTCTCAACTTCTTAGAAATGCAAGAAAGAATTGATTTCTATAAATCTTGTTGTGATCGATCATGTCCAGCCAATACCGAAGCCAAAAAGGGAAAGGATTAATTATGAGTGAGCGCAAGGTCGTTCTGATCACCGGATGCGGCAAGGGCGGCATCGGCTACGACTACTGCAAGGCTTTCGCCGACCTCAACTGCGCCGTCTTCGCCTCCGACGTCGCCCAACGGCTGCCCGACCTGGCCGACCTGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021575
ATGTCCAGCCAATACCGAAGCCAAAAAGGGAAAGGATTAATTATGAGTGAGCGCAAGGTCGTTCTGATCACCGGATGCGGCAAGGGCGGCATCGGCTACGACTACTGCAAGGCTTTCGCCGACCTCAACTGCGCCGTCTTCGCCTCCGACGTCGCCCAACGGCTGCCCGACCTGGCCGACCTGCAGTCGGAGCACGTGGAGACCCTCGAGCTCGATGTGTCCTCCGACGCGAGCGTGGCGGGCGCTGTGGATCTCGTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806815.1
MSSQYRSQKGKGLIMSERKVVLITGCGKGGIGYDYCKAFADLNCAVFASDVAQRLPDLADLQSEHVETLELDVSSDASVAGAVDLVISRRGRIDILINNAGIGSPGPLAELPLDAVRKAYEINALGQLRMVQRVVPHMATCGGGRIVNVGSVVGGVPTPWAGSYCATKAYVHAMSHALRVELKPFSIDVVLVLPGAVRSSFGSNNVDRLKDYEWKIYKNFSDSISERARMSQSGKSMDAAVFARHVARQVVSSNPPKTIT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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