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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002456`

染色体: Chr04 坐标: 39321217-39324864 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002456`
名称	SmilChr04G002456
描述	uncharacterized SmilChr04G002456
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39321217 - 39324864 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021584`
GeneID	`131021584`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021584`
原始查询	`SmilChr04G002456`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Serine carboxypeptidase S28 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836705]; symbol=AT5G65760; hit=AT5G65760; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Serine carboxypeptidase S28 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836705]; symbol=AT5G65760; hit=AT5G65760; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G65760` (AT5G65760) Serine carboxypeptidase S28 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836705] identity=72.7; qcov=0.884; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0767100` (OsProCP1) - identity=66.6; qcov=0.898; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005773 (vacuole); GO:0006508 (proteolysis); GO:0008239 (dipeptidyl-peptidase activity); GO:0070008 (serine-type exopeptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF05577 (Peptidase_S28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021584

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057806826.1`
2	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057806826.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806826.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806826.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806826.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39321502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr4:39323623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B109,B6,B9,C25
`Chr4:39323856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	158	A1,A10,A11,A13,A2,A21,A22,A24,A3,A5,A7,A8,B1,B101,B102,B105,B106,B108,B109,B111,B115,B117,B121,B123,B124,B126,B127,B128,B131,B132,B134,B135,B138,B139,B140,B18,B2,B20,B23,B24,B27,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B41,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B57,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B68,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B85,B86,B88,B89,B9,B91,B93,B94,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C25,C26,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C41,C42,C43,C44,C45,C48,C5,C50,C51,C52,C54,C56,C58,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C74,C75,C8,C83,C85,C87,D11,D3,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr4:39324099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr4:39324118`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	B105,B18
`Chr4:39324118`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B105,B18
`Chr4:39324131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:39324396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr4:39324667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	119	A10,A11,A13,A2,A22,A24,A3,A5,A7,B1,B106,B108,B110,B111,B115,B117,B121,B124,B126,B127,B131,B132,B134,B135,B140,B20,B23,B24,B27,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B36,B38,B39,B4,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B56,B57,B60,B61,B64,B68,B7,B71,B72,B73,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B86,B89,B9,B91,B93,B94,B96,C1,C10,C11,C14,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C26,C29,C30,C31,C33,C34,C36,C37,C41,C42,C43,C44,C45,C48,C51,C52,C54,C56,C58,C6,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C74,C82,C83,C87,D11,D3,D5,D6,D7,D9
`Chr4:39324707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806826.1

510 aa

255

510

Peptidase_S28

PF05577 Peptidase_S28 66-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806826.1`	Pfam	`PF05577`	Peptidase_S28	Domain	66	487	1.6e-83	281.7	Serine carboxypeptidase S28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950843.1
CTTTGAATAAGTCAATTTTTTGAGTAGCTTGGTCAGCCTGTTATTGCATTAGTTATTGTAACAGTCTCTTCCACAGCTGAACTCTCTCTCTGTAAGAAATGGCCGATTTCAAAGCTACTCTCTCTCTCCTAATCTTTTTTGCTGTACTCTCCTTCTTCCCACCAACGCTCTCCTCGCTGCCCGCTCCTCGCCTCTCCCGATCATCAAAATATGCTCCCCGCTATCTCGGAAAATTCCCTCGCTCCAACTATTCGGCTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021584
ATGGCCGATTTCAAAGCTACTCTCTCTCTCCTAATCTTTTTTGCTGTACTCTCCTTCTTCCCACCAACGCTCTCCTCGCTGCCCGCTCCTCGCCTCTCCCGATCATCAAAATATGCTCCCCGCTATCTCGGAAAATTCCCTCGCTCCAACTATTCGGCTTCTCCCACTTACCGATATGAGACTCGCTACTTCGACCAGAATCTCGACCATTTCAGCTTCTCGGAGCTACCCAAATTCCGCCAGCGCTACCTCATAAACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806826.1
MADFKATLSLLIFFAVLSFFPPTLSSLPAPRLSRSSKYAPRYLGKFPRSNYSASPTYRYETRYFDQNLDHFSFSELPKFRQRYLINTEHWAGPDHHGPIFFYCGNEGDIEWFAANTGFVWEIAPRFRAMIVFPEHRYYGESMPYGSREEAYRNTTTLAHLTAEQALADFSVLITELKRNLSAQACPVVLFGGSYGGMLASWMRLKYPHIAIGALASSAPILQFEDLVPPETFYDIVSNDFKRESVSCFNTIKDSWDVIES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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