当前解析结果
SmilChr04G002461| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002461 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002461 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002461 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 39436238 - 39442760 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021590 |
|---|---|
| GeneID | 131021590 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021590 |
| 原始查询 | SmilChr04G002461 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0233400; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os12g0233400; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G40710 (AT5G40710)zinc finger (C2H2 type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834071] identity=62.1; qcov=0.844; evalue=4.89e-107; confidence=high |
| Rice | Os12g0233400- identity=62.2; qcov=0.905; evalue=2.34e-115; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021590 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 1.00000 | XP_057806836.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057806836.1 |
| 3 | Trans-golgi network | Trans-golgi network | 0.20000 | XP_057806836.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057806836.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057806836.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:39440082 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C6 |
Chr4:39440246 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B115,B78,C2,C44 |
Chr4:39441254 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr4:39441255 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C57 |
Chr4:39441264 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。