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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002462`

染色体: Chr04 坐标: 39443057-39445603 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002462`
名称	SmilChr04G002462
描述	uncharacterized SmilChr04G002462
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39443057 - 39445603 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021591`
GeneID	`131021591`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021591`
原始查询	`SmilChr04G002462`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Radical SAM superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836449]; symbol=AT5G63290; hit=AT5G63290; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Radical SAM superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836449]; symbol=AT5G63290; hit=AT5G63290; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G63290` (AT5G63290) Radical SAM superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836449] identity=58.9; qcov=1.07; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0270100` - identity=63.2; qcov=0.923; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004109 (coproporphyrinogen oxidase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006779 (porphyrin-containing compound biosynthetic process); GO:0051539 (4 iron, 4 sulfur cluster binding)
KEGG	-
Pfam	PF04055 (Radical_SAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021591

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057806837.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057806837.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806837.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806837.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806837.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39443387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:39443512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr4:39443527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr4:39443530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,B93,C82
`Chr4:39443674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr4:39443712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr4:39444829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr4:39444850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C29
`Chr4:39444922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B33,B81,C41,C6
`Chr4:39445038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr4:39445059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:39445120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806837.1

454 aa

227

454

Radical_SAM

PF04055 Radical_SAM 44-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806837.1`	Pfam	`PF04055`	Radical_SAM	Domain	44	225	1.3e-20	74.9	Radical SAM superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950854.1
GGAAATTTATAATGGTTTTGTGAGTCACGTAAAATCCTTTGATTTAGAGGCTCCACTCTCCAGTGGTCGTAATTCGTAAAATATTAGTCCAAAATAGATGAGAAAAAAATGTGAGTGTTTTTAGACAGCAAATTGGGCAGAGATGCTGCTGAGATCAGCCTACGCTCCACTCCTCTCTTCTTTCTCCACAATCACCAATTCTCTCACACCAACTGTTCGACAAAATGCCCCACTACTACTTGAGCTGCCTCAACTCCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021591
ATGCTGCTGAGATCAGCCTACGCTCCACTCCTCTCTTCTTTCTCCACAATCACCAATTCTCTCACACCAACTGTTCGACAAAATGCCCCACTACTACTTGAGCTGCCTCAACTCCCTCCCGCTTCCGCCTACGTGCATCTCCCTTTCTGCCGCAAGCGCTGCCACTACTGCGACTTCCCCATCATCGCTCTCGGCTCCTCATCCGATCACCACGAGCACGACGACCCGCGTATCTCGAGCTACGTGGACACGCTCTGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806837.1
MLLRSAYAPLLSSFSTITNSLTPTVRQNAPLLLELPQLPPASAYVHLPFCRKRCHYCDFPIIALGSSSDHHEHDDPRISSYVDTLCREIAATKLSSTTCPPLQTVFLGGGTPSLVPPRLVSSVLDALSSKFGVSADAEISMEMDPGTFNAAAMKELMNLGVNRVSLGVQSFQAELLRSCGRAHGVGEIFEAVEIVKTCGVENWSVDLISSLPHQTPAMWEESLQLTVAAQPTHVSVYDLQVEQDTKFGTLYTPGEFPLPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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