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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002468`

染色体: Chr04 坐标: 39503152-39505282 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002468`
名称	SmilChr04G002468
描述	nucleoside diphosphate kinase 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39503152 - 39505282 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021598`
GeneID	`131021598`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021598`
原始查询	`SmilChr04G002468`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleoside diphosphate kinase 2, chloroplastic
产物	nucleoside diphosphate kinase 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G63310` (NDPK2) nucleoside diphosphate kinase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836451] identity=73.5; qcov=0.919; evalue=4.35e-101; confidence=high
Rice	`Os12g0548300` (OsNDPK2) - identity=84; qcov=0.703; evalue=2.29e-95; confidence=high
GO	GO:0004550 (nucleoside diphosphate kinase activity); GO:0006183 (GTP biosynthetic process); GO:0006228 (UTP biosynthetic process); GO:0006241 (CTP biosynthetic process)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00334 (NDK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021598

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057806843.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057806843.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806843.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806843.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806843.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39503934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:39503964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B111,B19,B61,B7
`Chr4:39503977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:39504120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:39504154`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A2,A6,B110,B30,B45,B52,B76,C15,C29,C50,C56,C6,C60,C62,C65,C9,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806843.1

222 aa

111

222

NDK

PF00334 NDK 75-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806843.1`	Pfam	`PF00334`	NDK	Domain	75	208	1e-56	191.2	Nucleoside diphosphate kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950860.1
TGACTTTGACGAAATAATTTTCCTACAAAACCAAGGTTACGCATAATTTATTTCATTTTGCCCCAAAGTTTAGAGAGAGAGAGAGAGTTTGGATGGAATGGATTCTGGTGTAGCTGTGTTTGGAGGAGCAACTCTCACTCCCTCCGTTTCTTCCTCACTTGCCACAAATGTTCGCTTATTCCACCTATCTCCCCACCGCCGGACCTCCCACCTCGCCGCCTTCCGCTCCACCTCCCATCTCTTCACACACTCCTCATCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021598
ATGGATTCTGGTGTAGCTGTGTTTGGAGGAGCAACTCTCACTCCCTCCGTTTCTTCCTCACTTGCCACAAATGTTCGCTTATTCCACCTATCTCCCCACCGCCGGACCTCCCACCTCGCCGCCTTCCGCTCCACCTCCCATCTCTTCACACACTCCTCATCTTTCAAGAGCCCCCTAAAACCCCACATCTTCCTCCCCCACTTAGTTGCTTCTCTGGAAGTGGAAGAAACTTATATTATGATTAAGCCAGATGGTGTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806843.1
MDSGVAVFGGATLTPSVSSSLATNVRLFHLSPHRRTSHLAAFRSTSHLFTHSSSFKSPLKPHIFLPHLVASLEVEETYIMIKPDGVQRGLVGEIISRFEKKGFKLTALKLFECPKELAEEHYKDLQSKPFFPKLISYITSGPVVCMAWEGVGVVASARKLIGATNPLNAEPGTIRGDLAVQTGRNVVHGSDSPENGKREIALWFKEGEVCEWAPILEPWLKE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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