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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002470`

染色体: Chr04 坐标: 39508606-39515466 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002470`
名称	SmilChr04G002470
描述	uncharacterized SmilChr04G002470
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39508606 - 39515466 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023420`
GeneID	`131023420`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023420`
原始查询	`SmilChr04G002470`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=45.7; qcov=0.455; evalue=5.04e-18; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=49.7; qcov=0.815; evalue=8.39e-36; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023420

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057808944.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057808944.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808944.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808944.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808944.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39508619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B78,C2
`Chr4:39508620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C14
`Chr4:39508624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr4:39508628`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	144	A11,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A24,A25,A5,A6,A9,B101,B103,B104,B105,B108,B109,B111,B114,B115,B117,B12,B120,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B131,B133,B135,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B23,B24,B25,B26,B27,B3,B31,B32,B4,B43,B45,B47,B48,B49,B50,B51,B52,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B65,B66,B68,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B82,B83,B84,B88,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B99,C1,C11,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C2,C24,C25,C26,C27,C28,C3,C32,C33,C34,C38,C39,C40,C44,C46,C47,C48,C50,C52,C54,C55,C57,C59,C6,C60,C61,C64,C65,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C78,C80,C81,C82,C85,C86,C87,D2,D3,D6
`Chr4:39508630`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	161	A1,A10,A13,A2,A20,A21,A23,A3,A4,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B102,B105,B106,B107,B108,B110,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B128,B129,B13,B130,B132,B134,B136,B137,B139,B140,B17,B18,B20,B21,B22,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B37,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B48,B5,B50,B53,B54,B55,B56,B59,B6,B60,B62,B63,B66,B67,B69,B70,B72,B74,B76,B78,B79,B8,B80,B86,B87,B89,B91,B94,B95,B96,B97,B98,C10,C11,C12,C14,C15,C16,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C28,C29,C30,C31,C35,C36,C37,C39,C4,C41,C42,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C67,C68,C69,C7,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C83,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D5,D7,D9
`Chr4:39508633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr4:39508652`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A8,B134,B140,C63,C87
`Chr4:39508652`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A8,B134,B140,C63,C87
`Chr4:39508674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B2
`Chr4:39508679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr4:39508680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B2,C2
`Chr4:39508683`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B59,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808944.1

178 aa

178

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 5-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808944.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	5	137	2.7e-38	132.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952961.1
ATGGCATGGAGCACTCGAGGGGATTACAACGAGCACACTATTATACTTGAGGCCGTTGCTTCCCAACATCTGTGGATCTGCCATGCCTTCGGAGTCACAATCTCGAACAATGATATCAACATTTCTCAATCAATTGACGTCCTTTTGGAGAATGAAGTAGCGGTGCACTTCGTGACTAACAATGCCCATTATACTAGAGGTTACTACTTAACCGATGACATCTACCCAGATTGGACAGTCTTCGTCAAGAGCTTCCCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023420
ATGGCATGGAGCACTCGAGGGGATTACAACGAGCACACTATTATACTTGAGGCCGTTGCTTCCCAACATCTGTGGATCTGCCATGCCTTCGGAGTCACAATCTCGAACAATGATATCAACATTTCTCAATCAATTGACGTCCTTTTGGAGAATGAAGTAGCGGTGCACTTCGTGACTAACAATGCCCATTATACTAGAGGTTACTACTTAACCGATGACATCTACCCAGATTGGACAGTCTTCGTCAAGAGCTTCCCATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808944.1
MAWSTRGDYNEHTIILEAVASQHLWICHAFGVTISNNDINISQSIDVLLENEVAVHFVTNNAHYTRGYYLTDDIYPDWTVFVKSFPFSSNQKKRRFKVMQETAIKDVERAFGVLQARWGIVKGSARLWKNEQMSNIIWLSQYGEWVLKSTSTRGAKEPDHRRLEVAPRAGDRCSATPG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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