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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002494`

染色体: Chr04 坐标: 39835092-39836623 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002494`
名称	SmilChr04G002494
描述	uncharacterized SmilChr04G002494
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39835092 - 39836623 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021623`
GeneID	`131021623`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021623`
原始查询	`SmilChr04G002494`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824264]; symbol=AT3G51000; hit=AT3G51000; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824264]; symbol=AT3G51000; hit=AT3G51000; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G51000` (AT3G51000) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824264] identity=58.6; qcov=1.01; evalue=1.33e-136; confidence=high
Rice	`Os12g0636400` - identity=51.9; qcov=1.01; evalue=1.16e-113; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021623

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806864.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057806864.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806864.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806864.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806864.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39835430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C27
`Chr4:39835721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr4:39835762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B3,C13
`Chr4:39835953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B34
`Chr4:39836171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B117,B14,B15,C55
`Chr4:39836252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B2,B40
`Chr4:39836357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B46,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806864.1

319 aa

160

319

Abhydrolase_1

Hydrolase_4

Abhydrolase_6

PF00561 Abhydrolase_1 28-302 aa PF12146 Hydrolase_4 29-134 aa PF12697 Abhydrolase_6 30-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806864.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	28	302	2.3e-25	90.4	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057806864.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	29	134	9.6e-11	42.2	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057806864.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	30	307	9.7e-18	66.3	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950881.1
TTATTATGTTTGGTGGACGGTCTAAGTATTGAATTGGCATATCAACCGATACAATGATAACAAATACTATAAGACAAAATTAGCAGCTCAACTGTACGTGGTCTCTGTCATTATTTATATTTATATGCATTAATCATCCTTGAGAGTTTTCAAGTGAGCGAGATTAATTAATTACTTAATTACCAAAGGTGAAAGCAGTCGGCGCCGATGATGATGGGATGCGATGTGAATCACCAAAGAGTAAAAGGCAACGGCATATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021623
ATGATGATGGGATGCGATGTGAATCACCAAAGAGTAAAAGGCAACGGCATATGGATGCACGTAGCTGAGAAAGGATCAGGGCCGTTGGTGCTGCTGCTCCATGGCTTCCCGGAGACCTGGTTCTCTTGGCACCGTCAGATGGAGTTCCTTGCCGGCCACGGCTACCACGCCGTCGCTCCCGATTTGCGAGGTTTCGGCGACACCGATGCCCCCCTCTCCCCTTCTTCTTACACTTGGCTCCACATCGTCGGCGATCTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806864.1
MMMGCDVNHQRVKGNGIWMHVAEKGSGPLVLLLHGFPETWFSWHRQMEFLAGHGYHAVAPDLRGFGDTDAPLSPSSYTWLHIVGDLIALLDHFSVQQAYVVGTDWGAAAAWQLSLLRPDRVKGIVALSVPFTPRFANVKPLEAMRQKYGDDFYVCQFQEAGRAERALARYDCATVMKKFLLINKTEMVVAPPGTEIIDFLETPSVTPPWITEDEIQLLAGKFQESGFTGGFNYYRALDLNWEVVAAWQGSKIGVPAKLIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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