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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002536`

染色体: Chr04 坐标: 40532499-40534077 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002536`
名称	SmilChr04G002536
描述	GATA transcription factor 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	40532499 - 40534077 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021660`
GeneID	`131021660`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021660`
原始查询	`SmilChr04G002536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GATA transcription factor 5-like
产物	GATA transcription factor 5-like
Arabidopsis	`AT5G66320` (GATA5) GATA transcription factor 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836764] identity=54.1; qcov=0.683; evalue=6.17e-66; confidence=high
Rice	`Os02g0645600` (OsGATA2) - identity=82.9; qcov=0.223; evalue=1.65e-37; confidence=weak
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00320 (GATA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021660

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806893.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806893.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806893.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806893.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806893.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:40532667`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	140	A10,A13,A15,A16,A19,A2,A23,A5,A7,A8,B1,B101,B102,B104,B107,B110,B111,B115,B117,B122,B123,B124,B125,B126,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B24,B29,B3,B32,B33,B34,B35,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B46,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B57,B59,B61,B63,B64,B7,B71,B72,B74,B75,B8,B81,B82,B84,B85,B86,B87,B88,B9,B90,B92,B95,B99,C1,C13,C15,C17,C2,C23,C24,C25,C27,C28,C29,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C40,C41,C43,C47,C48,C49,C5,C50,C53,C55,C56,C58,C59,C61,C63,C64,C68,C70,C71,C75,C76,C77,C78,C8,C81,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D4,D6,D8,D9
`Chr4:40532677`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A14,A19,A4,B105,B109,B112,B114,B3,B47,B49,B73,B83,B94,C14,C18,C24,C4,C47,C57,C7,C75,C79,C82,D3,D9
`Chr4:40533084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr4:40533105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:40533318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr4:40533351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr4:40533477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:40533535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:40533629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806893.1

341 aa

170

341

GATA

PF00320 GATA 260-294 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806893.1`	Pfam	`PF00320`	GATA	Domain	260	294	8.4e-17	61.2	GATA zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950910.1
TTCCGGTGTAAAATTTTTTCATTTATTCCACAGTTTTTTAGTCGGATGTGAATAATCCAAGCGTGGATTTTAAAAATTCCCACAAACATTTCAGAAATGTATTATTTGACTGCATATCCAAATCATATTAATTTGTTTATTTAGGTTTGAGATGCTTTTACCCAATCTGTCTCTCTCTCATTCAATGCTTTACCGAACTCACCACCACCCTTTTCTCTACACATTCAACCCTTTTTCCCCTTCCCCTTTATCCTCTATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021660
ATGCTTTTACCCAATCTGTCTCTCTCTCATTCAATGCTTTACCGAACTCACCACCACCCTTTTCTCTACACATTCAACCCTTTTTCCCCTTCCCCTTTATCCTCTATTCTCCTCTCCCCTCCTTCACCTCGTCTCCAGGAAATGGAGTGCGGTTTCATAGACGGGTTTGGGGCTGAGATGTTGAAAACCGCGGGCTTGGCCGACGATGACTTATTTGTAGACGAACTGCTTGACTTCTCTAACGACTTGGAAGAACACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806893.1
MLLPNLSLSHSMLYRTHHHPFLYTFNPFSPSPLSSILLSPPSPRLQEMECGFIDGFGAEMLKTAGLADDDLFVDELLDFSNDLEEHAHGEQHHQLDQPEDKEKTTASSLLLTPPPPDNDDFGSLPETQLTVPAEGLESLEWLSHFVEDSFSDYSLTGKLPPKLAAEKEGAATASEQPCFTTPVQTKARTKRARTGVRIWPILSPSFTESSTSSSSSSSSTTSFSPPNPWLLQSQTGESFLGKLAAKKQKKKPADGQPRRC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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