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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002563`

染色体: Chr04 坐标: 40954896-40961603 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002563`
名称	SmilChr04G002563
描述	cellulose synthase A catalytic subunit 5 [UDP-forming]-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	40954896 - 40961603 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021676`
GeneID	`131021676`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021676`
原始查询	`SmilChr04G002563`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cellulose synthase A catalytic subunit 5 [UDP-forming]-like
产物	cellulose synthase A catalytic subunit 5 [UDP-forming]-like
Arabidopsis	`AT5G09870` (CESA5) cellulose synthase 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830847] identity=78.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0424400` (OsCesA3) - identity=69.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009833 (plant-type primary cell wall biogenesis); GO:0016760 (cellulose synthase (UDP-forming) activity); GO:0030244 (cellulose biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF03552 (Cellulose_synt); PF13632 (Glyco_trans_2_3); PF14569 (zf-UDP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021676

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057806916.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057806916.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057806916.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806916.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806916.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:40955428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B24,B35,C20
`Chr4:40957293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C29
`Chr4:40957312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:40957654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B59,C81
`Chr4:40958060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:40958094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr4:40958268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:40958684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr4:40960023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,C86
`Chr4:40960115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B139,C18,C22,C27
`Chr4:40960368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr4:40960581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806916.1

1083 aa

542

1083

zf-UDP

Cellulose_synt

Glyco_trans_2_3

PF14569 zf-UDP 29-105 aa PF03552 Cellulose_synt 354-1070 aa PF13632 Glyco_trans_2_3 772-874 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806916.1`	Pfam	`PF14569`	zf-UDP	Domain	29	105	8.3e-40	135.4	Zinc-binding RING-finger
`XP_057806916.1`	Pfam	`PF03552`	Cellulose_synt	Domain	354	1070	0	1334.3	Cellulose synthase
`XP_057806916.1`	Pfam	`PF13632`	Glyco_trans_2_3	Domain	772	874	7.6e-07	29.8	Glycosyl transferase family group 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950933.1
TCTCTCTCTCTCTCTCGCACAAGAATCTATTATGGAGTTGAGGCGAATAATGCATCTTTGTTTGCATTTTTCGCATTTTCAAGAAACACAGTAGCTACCTTTTGGTTTTCCTCGACTTTCCACGCCGCACTATTATTATACTCATTTCCTATCGTTTTCTTCTTTTTTTTTTCTCTCACTGGACACTGCCTCTTGCTATTTAATCAGCGCTCTTCTAATGCAAGAACTTGGAATGTCTTCTAGTCCAAGACTCCAACTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021676
ATGGATACTGGAGGGAGGCTTGTGGCTGGTTCTCACAATAGAAATGAGTTTGTTCTCATCAATGCTGATGAAATTGGAAGAATTAAGTCTGTTGAAGAAGTGAGTGGAGAAACATGCCAAATTTGCGGAGATGAAGTGGAGATAAGTGTAGATGGGGAACTCTTTGTTGCATGCAATGAATGTGCTTTCCCTGTATGTCGAACTTGCTATGAATACGAGAGAAAGGAGGGAAGCCAGGCTTGTCCTCAGTGCAAAACCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806916.1
MDTGGRLVAGSHNRNEFVLINADEIGRIKSVEEVSGETCQICGDEVEISVDGELFVACNECAFPVCRTCYEYERKEGSQACPQCKTRYKRIKGSPRVEGDEEEDETDDLEHEFDYGNPEAPGFKQRVGGVPSVHASSTGSTTISSSQGLEIPLLTYNEEDTQIHYDRQAIIIPPFPGHGDGTHQTPNVQPRSMVPEKDIALYGYGSVAWRDRMEEWKRRQNDKVQVVDHQHSSDNGDLDSSEMDPDLPMMDEGRQPLSRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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