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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002581`

染色体: Chr04 坐标: 41175439-41178280 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002581`
名称	SmilChr04G002581
描述	uncharacterized SmilChr04G002581
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	41175439 - 41178280 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021696`
GeneID	`131021696`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021696`
原始查询	`SmilChr04G002581`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0589500; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0589500; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G09830` (AT4G09830) nuclear receptor family 2 group C protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826572] identity=53.7; qcov=0.962; evalue=1.7e-58; confidence=high
Rice	`Os01g0589500` - identity=56.9; qcov=0.991; evalue=3.4e-74; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF15251 (TAPR1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021696

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806957.1`
2	Nuclear body	核内小体	1.00000	`XP_057806957.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057806957.1`
4	PML body	PML body	0.20000	`XP_057806957.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806957.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:41175887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:41175907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C8
`Chr4:41175938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:41175971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,B82,C42,C60
`Chr4:41176001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B27,C23,D2
`Chr4:41176053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:41176103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:41177999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806957.1

211 aa

106

211

TAPR1-like

PF15251 TAPR1-like 16-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806957.1`	Pfam	`PF15251`	TAPR1-like	Family	16	200	3e-06	28.0	Telomere attrition and p53 response 1 protein-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950974.1
AAGTTCCACCTCCGTCCACTCCACCCTACCAGCCTTTCTCCAAAAATTGTTTTCTTTCTCATCGTAATTTCACACCACCTACACCGATACTCCATTCTCTCTGTATATCCATCTAGGGTTTGGGTTTTTCTTCCCAATTAAAATTCCCCCAAACTTATGGCCAAGAAGAGGAAATCCGATGCGTCGCGCCTCGATGAGGTCGATCGAGGGATGTACACCACTTTCTGCACCGCGGCCAACTCCCTCTCCCAGCTCTACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021696
ATGGCCAAGAAGAGGAAATCCGATGCGTCGCGCCTCGATGAGGTCGATCGAGGGATGTACACCACTTTCTGCACCGCGGCCAACTCCCTCTCCCAGCTCTACACGCACGCGATGCACCAGCAGCGCCTCTCCTTCCAAGCCGGTGAACGCCACTCGCTGGAAAAGCTTTACAATTGGATTTTAAGACAGCAAGAGCATGGGGTTAGAGTGATGAGCGGCGACATACTCGCATATGTGCAGAATGAACTTGATTATGGAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806957.1
MAKKRKSDASRLDEVDRGMYTTFCTAANSLSQLYTHAMHQQRLSFQAGERHSLEKLYNWILRQQEHGVRVMSGDILAYVQNELDYGTEEPPPSPRLPLQQQTQPQPNNNLMQLPQTGLPISSNAFGPATIGQGPRAGNSDQSKNSVFSNALSSPVRRTLQHYHLSQGGFSSNNATRSNENSTNQNRDTNPLSSNDTSMDMHSDSPGHDSPY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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