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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002586`

染色体: Chr04 坐标: 41276939-41279068 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002586`
名称	SmilChr04G002586
描述	iron-sulfur assembly protein IscA, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	41276939 - 41279068 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021700`
GeneID	`131021700`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021700`
原始查询	`SmilChr04G002586`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	iron-sulfur assembly protein IscA, chloroplastic
产物	iron-sulfur assembly protein IscA%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G10500` (CPISCA) chloroplast-localized ISCA-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837590] identity=80.5; qcov=0.719; evalue=1.18e-75; confidence=high
Rice	`Os06g0146400` (OsISC7) - identity=61.2; qcov=1; evalue=1.18e-68; confidence=high
GO	GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly); GO:0030674 (protein-macromolecule adaptor activity); GO:0051536 (iron-sulfur cluster binding)
KEGG	-
Pfam	PF01521 (Fe-S_biosyn)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021700

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057806962.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057806962.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806962.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806962.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806962.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:41277084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:41277140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr4:41277377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:41277497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B22,C11,C69
`Chr4:41278701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806962.1

178 aa

178

Fe-S_biosyn

PF01521 Fe-S_biosyn 70-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806962.1`	Pfam	`PF01521`	Fe-S_biosyn	Domain	70	172	1.9e-22	80.3	Iron-sulphur cluster biosynthesis

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950979.1
AAGTCATCACCAGTGTCATTTTTGTGTTGAGTGTTCATATTTGTCAATACTTGAGAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGACAAAACAAAATACAGTATCTTGTTTTTCCAGTGGTTATTATTCCCCCTATAATATTTTAGAGCCACACACAAATAAAAAATTAGAATCAATTAAATACACTAAAATCAAATTTCCCTCAAAATTCAACAACCTAAACCCGCGTGCCACTAGCTACACACAAGAATTTATTTCTTGGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021700
ATGGCTTCCTCACAATCTCTGCAATCTCTAACAGTTTCTCGCTTACACAAATCTTCAAGCCCAGTTCGATTTTCTTCCCTCCCTTCTTCTTCCTCCTCTCTCTCCTTTCGGTTTTCCCCTTCATTTCTCAACCGCAAGAGACCCCTTTTGTCAATTAGGTCTGCGTCTGTGGAAGCTCCATCAGCAGCTGGGGGTCTAGCACCTGCTATCGCTTTGACGGACAATGCATTGACGCACTTAAATAAAATGAGATCCGAGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806962.1
MASSQSLQSLTVSRLHKSSSPVRFSSLPSSSSSLSFRFSPSFLNRKRPLLSIRSASVEAPSAAGGLAPAIALTDNALTHLNKMRSERNEDLCLRIGVKQGGCSGMSYTMEFESKANTRPDDSVMEYNGFNIVCDPKSLLFLYGMQLDYSDALIGGGFNFKNPNATQTCGCGKSFAAEM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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