当前解析结果
SmilChr04G002617| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002617 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002617 |
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 13-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 41583390 - 41583962 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023448 |
|---|---|
| GeneID | 131023448 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023448 |
| 原始查询 | SmilChr04G002617 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 13-like |
| 产物 | UDP-glycosyltransferase 13-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0289900 (UGT)- identity=38.7; qcov=0.395; evalue=7.78e-12; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023448 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057808972.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057808972.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808972.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808972.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808972.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:41583399 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A1,B56,C40,C48,D11 |
Chr4:41583419 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B48,B60 |
Chr4:41583432 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr4:41583436 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,B105,B59,C19,C39 |
Chr4:41583438 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B38 |
Chr4:41583439 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C69 |
Chr4:41583444 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr4:41583486 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B137,B71 |
Chr4:41583489 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C54 |
Chr4:41583495 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A1,C18 |
Chr4:41583554 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,B96 |
Chr4:41583557 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C14,C18,C24 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。