当前解析结果
SmilChr04G002640| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002640 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002640 |
| 描述 | pyruvate kinase 1, cytosolic-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 41799818 - 41800576 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023451 |
|---|---|
| GeneID | 131023451 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023451 |
| 原始查询 | SmilChr04G002640 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | pyruvate kinase 1, cytosolic-like |
| 产物 | pyruvate kinase 1%2C cytosolic-like |
| Arabidopsis | AT3G52990 (AT3G52990)Pyruvate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824465] identity=80; qcov=0.951; evalue=1.86e-86; confidence=high |
| Rice | Os11g0148500 (OsPK1)- identity=80.6; qcov=0.951; evalue=4.95e-87; confidence=high |
| GO | GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004743 (pyruvate kinase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006096 (glycolytic process); GO:0030955 (potassium ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00224 (PK) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023451 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057808974.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057808974.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057808974.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808974.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808974.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057808974.1PF00224
PK 2-98 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057808974.1 |
Pfam | PF00224 |
PK | Domain | 2 | 98 | 9.6e-35 | 120.9 | Pyruvate kinase, barrel domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。