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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002644`

染色体: Chr04 坐标: 41812893-41813807 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002644`
名称	SmilChr04G002644
描述	uncharacterized SmilChr04G002644
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	41812893 - 41813807 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023452`
GeneID	`131023452`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023452`
原始查询	`SmilChr04G002644`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0930300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0930300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=23.7; qcov=1.01; evalue=2.63e-12; confidence=weak
Rice	`Os01g0930300` - identity=21.9; qcov=1.01; evalue=3.61e-16; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023452

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808975.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808975.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808975.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808975.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808975.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:41812969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr4:41812976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr4:41812992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B106,C35
`Chr4:41812998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B122,C16,C61
`Chr4:41813027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:41813082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr4:41813101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,C61
`Chr4:41813111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B4,B59,B97
`Chr4:41813128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B120,C19,C27
`Chr4:41813168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C50
`Chr4:41813168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr4:41813192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808975.1

304 aa

152

304

RVT_3

PF13456 RVT_3 157-278 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808975.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	157	278	3.4e-18	66.4	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952992.1
ATGTGGAGGGCAGTTCAAAATTTGTTGGCCTCGGATTTGAACCTTCACCATAGACATATTTCTAGCTCGGGCATTTGTTCTTGGTGTCATAAGGACTGGGGTTCAACGGTGCATTGTCTCATCTTTTGCGATGTTACTAGAGGGGCTTGGAAGAAAACTAAGTGGTGGCTGGTGGTTAAAAATAAGAAACATTTCCTTCTTGAAGATATTTGCCGCGCGGTGATTGAGTCTTCGGATAGAGAGGGTTTTGATCTGTTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023452
ATGTGGAGGGCAGTTCAAAATTTGTTGGCCTCGGATTTGAACCTTCACCATAGACATATTTCTAGCTCGGGCATTTGTTCTTGGTGTCATAAGGACTGGGGTTCAACGGTGCATTGTCTCATCTTTTGCGATGTTACTAGAGGGGCTTGGAAGAAAACTAAGTGGTGGCTGGTGGTTAAAAATAAGAAACATTTCCTTCTTGAAGATATTTGCCGCGCGGTGATTGAGTCTTCGGATAGAGAGGGTTTTGATCTGTTTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808975.1
MWRAVQNLLASDLNLHHRHISSSGICSWCHKDWGSTVHCLIFCDVTRGAWKKTKWWLVVKNKKHFLLEDICRAVIESSDREGFDLFCVSLWWTWSWLCKAKHDCDFKKDLELVVGCADFLCSFHEARRTFLTKDRLLPNVGDNSWIPPPAGLFRLDTDVSIQGNGEATGAGFLVRDHRGKIIAAAAHRVGRTETVLMGELHAMLLGIGFCLENQIGPLLVFTDSLLAVHVVHEDSAGSESLCDELFEVFSHARHHLVLDF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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