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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002646`

染色体: Chr04 坐标: 41821176-41823381 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002646`
名称	SmilChr04G002646
描述	mitochondrial pyruvate carrier 3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	41821176 - 41823381 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023455`
GeneID	`131023455`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023455`
原始查询	`SmilChr04G002646`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial pyruvate carrier 3-like
产物	mitochondrial pyruvate carrier 3-like
Arabidopsis	`AT4G05590` (AT4G05590) pyruvate carrier-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825927] identity=71.4; qcov=0.955; evalue=1.82e-53; confidence=high
Rice	`Os08g0344300` - identity=67.3; qcov=0.973; evalue=2.59e-51; confidence=high
GO	GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0006850 (pyruvate import into mitochondria)
KEGG	-
Pfam	PF03650 (MPC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023455

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057808977.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057808977.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057808977.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808977.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808977.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:41821201`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A20,B34,B36,B65,B77,C15,C51,D6
`Chr4:41823083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr4:41823198`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A19,A25,A4,B105,B109,B112,B114,B3,B47,B49,B73,B83,B94,C4,C52,C57,C7,C71,C79,C82,D9
`Chr4:41823200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B122,B46,C11,C69
`Chr4:41823203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B35,B55,B7,C23
`Chr4:41823221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:41823242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B108,B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808977.1

110 aa

110

MPC

PF03650 MPC 2-99 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808977.1`	Pfam	`PF03650`	MPC	Repeat	2	99	3.2e-36	124.9	Mitochondrial pyruvate carriers

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952994.1
AGGAAACAAGCAAGTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGATGAATTCGAAGCTGCGGAGTCTGTGGAACCACCCGGCGGGGCCAAAAACGATTCATTTCTGGGCGCCGACGTTCAAGTGGGGGCTGAGCATCGCCAACATCTCCGACTTCCAGAAGCCGCCGGAAACGCTTTCCTACCCCCAGCAGTCCGTCATCGCCGTCTCCGGCGTCATCTGGTCGCGCTACTGCTTCGTCATCAAGCCATGGAATCTCAACCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023455
ATGAATTCGAAGCTGCGGAGTCTGTGGAACCACCCGGCGGGGCCAAAAACGATTCATTTCTGGGCGCCGACGTTCAAGTGGGGGCTGAGCATCGCCAACATCTCCGACTTCCAGAAGCCGCCGGAAACGCTTTCCTACCCCCAGCAGTCCGTCATCGCCGTCTCCGGCGTCATCTGGTCGCGCTACTGCTTCGTCATCAAGCCATGGAATCTCAACCTCTTCGGCGTCAACTCCGCCATGGCTTGCACCGGACTCTACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808977.1
MNSKLRSLWNHPAGPKTIHFWAPTFKWGLSIANISDFQKPPETLSYPQQSVIAVSGVIWSRYCFVIKPWNLNLFGVNSAMACTGLYQLSRKLRHDYSYQYANSLVSFTVE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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