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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002657`

染色体: Chr04 坐标: 41966806-41972197 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002657`
名称	SmilChr04G002657
描述	protein CPR-5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	41966806 - 41972197 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021767`
GeneID	`131021767`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021767`
原始查询	`SmilChr04G002657`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CPR-5-like
产物	protein CPR-5-like
Arabidopsis	`AT5G64930` (CPR5) CPR5 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836617] identity=36.1; qcov=0.847; evalue=2.62e-102; confidence=medium
Rice	`Os02g0770100` - identity=45.6; qcov=0.556; evalue=4.3e-86; confidence=medium
GO	GO:0006952 (defense response); GO:0010090 (trichome morphogenesis); GO:0010150 (leaf senescence)
KEGG	-
Pfam	PF28583 (CPR5_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021767

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus membrane	核膜	1.00000	`XP_057807032.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057807032.1`
3	Nucleus inner membrane	Nucleus inner membrane	0.60000	`XP_057807032.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057807032.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057807032.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:41967177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B44
`Chr4:41967314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr4:41969359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B81,C41,C6,C73,C86
`Chr4:41969662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B125,B140,B30,B44
`Chr4:41969787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B28,B58
`Chr4:41969824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B125,B140,B30,B44
`Chr4:41970069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B125,B30
`Chr4:41971577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:41971810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C24,C29,C47,C5
`Chr4:41971829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B124,B71,B89
`Chr4:41971908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807032.1

619 aa

310

619

CPR5_C

PF28583 CPR5_C 321-598 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807032.1`	Pfam	`PF28583`	CPR5_C	Domain	321	598	9e-139	462.1	Protein CPR-5 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951049.1
TTTAACGTCTCAAAATTCAAATACGGATAAAACATGGGCCACAAATAACGGTATGAAGAAGTCTAGGGCCTGAAACGAAAATTTCGCACTTTACAAATATTGCAAAATGATTCAAACTTGTCAAATGTATATTTATTAGACCGAATTTCAAATCAGAAACCCCCCAATAGTTTCCAATGGATGCCCCTCTCCACCGCCACGCCACATCACCGGACAGCTGTGCCGCCGAAGATCCGGCGGTCATGATGTCAACCAGCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021767
ATGGATGCCCCTCTCCACCGCCACGCCACATCACCGGACAGCTGTGCCGCCGAAGATCCGGCGGTCATGATGTCAACCAGCCACACAATCGACGCCCCGCAACCAACATCGAGAAGAAAGATTAATAAGAAGAAGAAACAGACAGTAGTTTCGGACAATGCATCATTAGAGTCTTCGAGTAATTGTAGCTCTGCGGCCTCGTATTCGAAAAAGGGCATCAAGATTTCTAGAAATCCTAAAAGAATTCGCGTCGGGCCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807032.1
MDAPLHRHATSPDSCAAEDPAVMMSTSHTIDAPQPTSRRKINKKKKQTVVSDNASLESSSNCSSAASYSKKGIKISRNPKRIRVGPLTAGPRNVGLSDVDALGLPLGMSIAAVVAQVLEKKNAAGKKISVDYLSAICGLAVRESIGNVFGDKFNNLVTNFETSFRSTLTTLQLISCSSQNDGEKLQGARFVGCSCSVTSNMTCGDTYKDSACPPEATEKESCVHANITKRQQGSGYQDSTSESSNLSSHFRIGDMACLSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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