当前解析结果
SmilChr04G002658| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002658 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002658 |
| 描述 | protein HEAT INTOLERANT 4-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 41974289 - 41981137 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131021768 |
|---|---|
| GeneID | 131021768 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021768 |
| 原始查询 | SmilChr04G002658 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein HEAT INTOLERANT 4-like |
| 产物 | protein HEAT INTOLERANT 4-like |
| Arabidopsis | AT5G10010 (AT5G10010)myosin-H heavy protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830863] identity=70.4; qcov=0.809; evalue=2.91e-160; confidence=high |
| Rice | Os04g0661300- identity=60.6; qcov=0.858; evalue=4.43e-138; confidence=high |
| GO | GO:1900034 (regulation of cellular response to heat) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021768 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057807033.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057807033.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.60000 | XP_057807033.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057807033.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.20000 | XP_057807033.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:41975830 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B28 |
Chr4:41976541 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A19,A25,A4,B47,D3 |
Chr4:41978096 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B124 |
Chr4:41980896 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。