当前解析结果
SmilChr04G002695| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002695 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002695 |
| 描述 | FCS-Like Zinc finger 7 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 42392802 - 42396174 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131021804 |
|---|---|
| GeneID | 131021804 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021804 |
| 原始查询 | SmilChr04G002695 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | FCS-Like Zinc finger 7 |
| 产物 | FCS-Like Zinc finger 7 |
| Arabidopsis | AT1G78020 (AT1G78020)senescence-associated family protein, putative (DUF581) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844137] identity=41.6; qcov=1.13; evalue=4.68e-28; confidence=medium |
| Rice | Os08g0407600- identity=64.7; qcov=0.375; evalue=1.19e-20; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04570 (zf-FLZ) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021804 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057807076.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057807076.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057807076.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057807076.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057807076.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:42393095 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C58 |
Chr4:42395724 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057807076.1PF04570
zf-FLZ 59-107 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057807076.1 |
Pfam | PF04570 |
zf-FLZ | Domain | 59 | 107 | 6.1e-26 | 90.4 | zinc-finger of the FCS-type, C2-C2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。