当前解析结果
SmilChr04G002715| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002715 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002715 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002715 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 42760769 - 42762303 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023469 |
|---|---|
| GeneID | 131023469 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023469 |
| 原始查询 | SmilChr04G002715 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT1G43760 (AT1G43760)DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=27.1; qcov=0.788; evalue=5.92e-41; confidence=low |
| Rice | Os06g0484800- identity=25.4; qcov=0.841; evalue=8.66e-44; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023469 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808994.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057808994.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057808994.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808994.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808994.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:42761253 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B76 |
Chr4:42761323 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B5,C16,C49 |
Chr4:42761331 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C31 |
Chr4:42761338 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B115,B91 |
Chr4:42761339 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A21 |
Chr4:42761383 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B36 |
Chr4:42761385 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B83 |
Chr4:42761385 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B83 |
Chr4:42761499 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B84,B90,C31 |
Chr4:42761500 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,B115,B91 |
Chr4:42761517 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B11 |
Chr4:42761584 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,A24,B115,B70,B91 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。