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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002726`

染色体: Chr04 坐标: 42876551-42880067 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002726`
名称	SmilChr04G002726
描述	UDP-N-acetylglucosamine transporter ROCK1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	42876551 - 42880067 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021827`
GeneID	`131021827`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021827`
原始查询	`SmilChr04G002726`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UDP-N-acetylglucosamine transporter ROCK1
产物	UDP-N-acetylglucosamine transporter ROCK1
Arabidopsis	`AT5G65000` (AT5G65000) Nucleotide-sugar transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836624] identity=73.3; qcov=0.984; evalue=4.41e-117; confidence=high
Rice	`Os02g0573300` - identity=74.1; qcov=0.455; evalue=3.8e-53; confidence=medium
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0015165 (pyrimidine nucleotide-sugar transmembrane transporter activity); GO:0090481 (pyrimidine nucleotide-sugar transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF04142 (Nuc_sug_transp); PF16913 (PUNUT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021827

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057807099.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057807101.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807099.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807099.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807099.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:42877864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr4:42879633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:42879692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B120,B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807099.1

331 aa

166

331

Nuc_sug_transp

PUNUT

PF04142 Nuc_sug_transp 28-319 aa PF16913 PUNUT 98-224 aa

XP_057807101.1

255 aa

128

255

Nuc_sug_transp

PUNUT

PF04142 Nuc_sug_transp 28-254 aa PF16913 PUNUT 98-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807099.1`	Pfam	`PF04142`	Nuc_sug_transp	Family	28	319	2.7e-33	116.1	Nucleotide-sugar transporter
`XP_057807099.1`	Pfam	`PF16913`	PUNUT	Family	98	224	3.5e-11	43.7	Purine nucleobase transmembrane transport
`XP_057807101.1`	Pfam	`PF04142`	Nuc_sug_transp	Family	28	254	2.2e-23	83.6	Nucleotide-sugar transporter
`XP_057807101.1`	Pfam	`PF16913`	PUNUT	Family	98	224	1.5e-11	44.9	Purine nucleobase transmembrane transport

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951116.1
GTAATCTTCTAGAAATGTTTTTGACTATCAACGGCCATACGACGTCGTCTCGCAGCCAAAAACGACCGTCTTTAACACCTCACCTTTTCGCAAAGAGGAGTTGCAGAAGGAAAAAAGCTTCCAATTTAGGCATAACTTCTTCTTCTTGCTCTCTTGCGACCCCTCGAATCTCCGATCGCCGCATCAATGGCGATCGGTAAGCTCCAGCCCACGAAGCCCGGCCCGATCAACCCCAATCCCAATGCCAGCACAAAGGTCTG...

XM_057951118.1
GGCCATACGACGTCGTCTCGCAGCCAAAAACGACCGTCTTTAACACCTCACCTTTTCGCAAAGAGGAGTTGCAGAAGGAAAAAAGCTTCCAATTTAGGCATAACTTCTTCTTCTTGCTCTCTTGCGACCCCTCGAATCTCCGATCGCCGCATCAATGGCGATCGGTAAGCTCCAGCCCACGAAGCCCGGCCCGATCAACCCCAATCCCAATGCCAGCACAAAGGTCTGGCTCTTCTCCTTGCTACTAACGCTGCAGTACG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021827
ATGGCGATCGGTAAGCTCCAGCCCACGAAGCCCGGCCCGATCAACCCCAATCCCAATGCCAGCACAAAGGTCTGGCTCTTCTCCTTGCTACTAACGCTGCAGTACGGTGCTCAGCCTCTCATCTCCAAACGTTTCACCAGCCGGGAAGTTATTGTGACTTCGTCAGTTTTGGCATGTGAGCTGGTAAAGGTGATTTGTGCTCTGTTTCTTTTGGCAAAAGATGGAAGTCTGAGAAAGGTATTGAAAGAGTGGACTTTGGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807099.1
MAIGKLQPTKPGPINPNPNASTKVWLFSLLLTLQYGAQPLISKRFTSREVIVTSSVLACELVKVICALFLLAKDGSLRKVLKEWTLVGSLTASGLPAAIYALQNSLLQISYKNLDSLTFSMLNQTKLFFTAFFTYIILRQRQSIQQIGALFILIIAAVLLSIGEGSSKASSAKNPDEILFYGIVPVLVASVLSGLASALCQWASQVKKHASYLMTVEMSIIGSLCLLASAYKSPDGLAIRKLGFFHGWTPWTWIPVILNA...

XP_057807101.1
MAIGKLQPTKPGPINPNPNASTKVWLFSLLLTLQYGAQPLISKRFTSREVIVTSSVLACELVKVICALFLLAKDGSLRKVLKEWTLVGSLTASGLPAAIYALQNSLLQISYKNLDSLTFSMLNQTKLFFTAFFTYIILRQRQSIQQIGALFILIIAAVLLSIGEGSSKASSAKNPDEILFYGIVPVLVASVLSGLASALCQWASQVKKHASYLMTVEMSIIGSLCLLASAYKSPDGLAIRKLGFFHGWTPWTWFQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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