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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002727`

染色体: Chr04 坐标: 42882603-42885612 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002727`
名称	SmilChr04G002727
描述	ras-related protein RABH1e
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	42882603 - 42885612 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021828`
GeneID	`131021828`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021828`
原始查询	`SmilChr04G002727`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ras-related protein RABH1e
产物	ras-related protein RABH1e
Arabidopsis	`AT5G10260` (RABH1e) RAB GTPase homolog H1E [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830890] identity=92.8; qcov=1; evalue=3.45e-144; confidence=high
Rice	`Os07g0496000` (OsRab6A1) - identity=88; qcov=1; evalue=1.51e-128; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00009 (GTP_EFTU); PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF01926 (MMR_HSR1); PF08477 (Roc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021828

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057807102.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057807102.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057807102.1`
4	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057807102.1`
5	Endosome	内体	1.00000	`XP_057807102.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:42882888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B122,C11,C69
`Chr4:42883395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B27
`Chr4:42885276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B140,C39
`Chr4:42885302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807102.1

207 aa

104

207

Arf

Roc

Ras

MMR_HSR1

GTP_EFTU

PF00025 Arf 9-167 aa PF08477 Roc 11-125 aa PF00071 Ras 11-169 aa PF01926 MMR_HSR1 12-119 aa PF00009 GTP_EFTU 43-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807102.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	9	167	3.5e-15	56.6	ADP-ribosylation factor family
`XP_057807102.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	11	125	2.4e-37	128.5	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057807102.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	11	169	5.7e-58	195.8	Ras family
`XP_057807102.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	12	119	5.2e-05	24.1	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057807102.1`	Pfam	`PF00009`	GTP_EFTU	Domain	43	171	2.1e-07	31.4	Elongation factor Tu GTP binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951119.1
CCATGTGACTTGAGTGTGAGTGCATTGCATGACTTCATATAACTGTTTTCATTTCCTAAACCTTTCCCACAAATCCACGATACGTTATTTTTCCCCTACCTGCCTATCAATACCCTCTCTCTCTCTCTCTTCAATATTTTCCATAAATTTCTCTAACCTCTCCTCTACGCAGATTTAGATCTCATCGTCATCGTCCTTCTCTCCAATGGCGGTGGTGTCACCATTAGCCAAGTACAAACTGGTGTTTCTCGGCGATCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021828
ATGGCGGTGGTGTCACCATTAGCCAAGTACAAACTGGTGTTTCTCGGCGATCAATCCGTCGGAAAAACCAGCATCATCACCCGCTTCATGTACGATAAATTTGATACCACCTATCAGGCCACTATAGGCATCGACTTCTTGTCGAAAACTATGTATCTTGAAGATCGAACAGTTCGCTTGCAACTTTGGGATACTGCTGGACAAGAAAGATTTCGAAGTCTTATTCCAAGCTACATTAGAGATTCTTCAGTGGCAGTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807102.1
MAVVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVANRQSFLNTTKWIEEVRTERGGDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIEEGDNKARETNIMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTSNSSQAEQQGGGCAC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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