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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002734`

染色体: Chr04 坐标: 43005287-43006622 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002734`
名称	SmilChr04G002734
描述	zinc finger protein STAR3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	43005287 - 43006622 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021834`
GeneID	`131021834`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021834`
原始查询	`SmilChr04G002734`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein STAR3-like
产物	zinc finger protein STAR3-like
Arabidopsis	`AT1G34370` (STOP1) C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840339] identity=61.3; qcov=0.566; evalue=2.26e-76; confidence=medium
Rice	`Os02g0572900` - identity=52; qcov=0.946; evalue=1.46e-94; confidence=high
GO	GO:0010044 (response to aluminum ion); GO:0010447 (response to acidic pH)
KEGG	-
Pfam	PF00096 (zf-C2H2); PF12874 (zf-met); PF23115 (zf-C2H2_STOP2_3rd); PF23118 (zf-C2H2_STOP2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021834

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807110.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807110.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807110.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807110.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057807110.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:43005660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B3,B84,C13,C20
`Chr4:43005669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:43005674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B25,B81,C41,C6,D11
`Chr4:43005694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C11,C69
`Chr4:43005753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:43005796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:43005849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:43005883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C11,C69
`Chr4:43005936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:43005969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:43006111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C31
`Chr4:43006158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807110.1

297 aa

148

297

zf-C2H2

zf-met

zf-C2H2_STOP2_3rd

zf-C2H2_STOP2_C

PF00096 zf-C2H2 111-133 aa PF12874 zf-met 112-131 aa PF23115 zf-C2H2_STOP2_3rd 156-190 aa PF23118 zf-C2H2_STOP2_C 221-250 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807110.1`	Pfam	`PF00096`	zf-C2H2	Domain	111	133	7.1e-06	26.9	Zinc finger, C2H2 type
`XP_057807110.1`	Pfam	`PF12874`	zf-met	Domain	112	131	0.00018	22.4	Zinc-finger of C2H2 type
`XP_057807110.1`	Pfam	`PF23115`	zf-C2H2_STOP2_3rd	Domain	156	190	7.8e-18	64.9	STOP2-like, C2H2-type zinc finger
`XP_057807110.1`	Pfam	`PF23118`	zf-C2H2_STOP2_C	Domain	221	250	1.7e-20	73.0	STOP2-like, C2H2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951127.1
AATACGGGTGAAACTTGAGATGAATGTTAATGTGAGTCGGGTAAATTCTTAGCACCCTCCTATTCCCATGTACAGTATTGTGACTCTCAAAATACGTATAAATGTACGCCTCTTTCCTCGACAAAGTTGAAAGTTCCCGATCTGATTTCCCTTTTTGCCACGTGTCAATTAGATACACTGTGGACACCAGAGATGCCACCTTTTCCCTCTAGCAAAGTCAAACTTGATTTCCCTATTTCACAGAAAACTCCCAAACCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021834
ATGTCCTTTCTCGGCGACACGAAGCCGCCCGGCGCCGCCGACCCACGAGTTCCGTTGATGAATCTGTCAGCCGTCCAAGCCCGCATGGACAATCTTCAGCAATTCCTGTCTGCTTCAGTGAGCAGCAACACTCCGATCGGCCAGCCTCAAATGGAAATGGTGTCCGCGGAGATCGCCTCCGCGATTCACCAGATCATAGTCAATGGCGCCGCCCTTTTGTCTTGCACGCCATCTGTTTGTTCAAATGACGCAGTGAATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807110.1
MSFLGDTKPPGAADPRVPLMNLSAVQARMDNLQQFLSASVSSNTPIGQPQMEMVSAEIASAIHQIIVNGAALLSCTPSVCSNDAVNPKAEEEEDYEIIEMDAVELLAEHVHFCEICGKGFKRDANLRMHMRAHGNQFKTPEALAKPEKGGGRKTRFSCPYVGCNRNRQHGKFRALKSAVCVKNHFKRSHCPKMYSCDRCHKKSFSVMADLKSHLKHCGETKWRCSCGTSFSRKDKLFGHMALFEGHMPALQLEDKRRKPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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