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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002739`

染色体: Chr04 坐标: 43058843-43060940 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002739`
名称	SmilChr04G002739
描述	uncharacterized SmilChr04G002739
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	43058843 - 43060940 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021838`
GeneID	`131021838`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021838`
原始查询	`SmilChr04G002739`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Putative membrane lipoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837577]; symbol=AT1G10380; hit=AT1G10380; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Putative membrane lipoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837577]; symbol=AT1G10380; hit=AT1G10380; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G10380` (AT1G10380) Putative membrane lipoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837577] identity=45; qcov=0.85; evalue=1.13e-52; confidence=medium
Rice	`Os06g0364500` - identity=30.4; qcov=0.898; evalue=5.55e-21; confidence=low
GO	GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF13947 (GUB_WAK_bind); PF14380 (WAK_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021838

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057807138.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807138.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807138.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807138.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807138.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:43058923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C85
`Chr4:43060235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr4:43060260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr4:43060279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr4:43060287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C19
`Chr4:43060460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr4:43060463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,C31
`Chr4:43060547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr4:43060568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr4:43060654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:43060711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C31
`Chr4:43060856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B122,B27,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807138.1

293 aa

146

293

GUB_WAK_bind

WAK_assoc

PF13947 GUB_WAK_bind 22-83 aa PF14380 WAK_assoc 222-253 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807138.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	22	83	6.7e-11	43.1	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding
`XP_057807138.1`	Pfam	`PF14380`	WAK_assoc	Domain	222	253	2.4e-06	28.9	Wall-associated receptor kinase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951155.1
CCAAATAATTAACATTTCTCTCTCTCTCTCAAGGCATCAATTCTCCCATCTGAAGTAGTGAAGTGAGAGAATGAACACTCTTCTCCTGGCCATAATGTTCCACTCCATTGTGACATCAGCCATGGAAACCCCATGCAAGAAAAGCTGCGGCTCAATCCAAATCAAGTACCCTTTTGGCTCCGGCCGCGGCTGCGGGTCCCCTCGATTCCACCCCTACGTGGCGTGCTCCGCCGCCACCAACCAGCTCCTCCTGACCACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021838
ATGAACACTCTTCTCCTGGCCATAATGTTCCACTCCATTGTGACATCAGCCATGGAAACCCCATGCAAGAAAAGCTGCGGCTCAATCCAAATCAAGTACCCTTTTGGCTCCGGCCGCGGCTGCGGGTCCCCTCGATTCCACCCCTACGTGGCGTGCTCCGCCGCCACCAACCAGCTCCTCCTGACCACCCACACGGGCACCTACCCCATCACCTCCGTCGACTACTCCGGCGGCGTGATCACCGTCGCCCCGCCGTGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807138.1
MNTLLLAIMFHSIVTSAMETPCKKSCGSIQIKYPFGSGRGCGSPRFHPYVACSAATNQLLLTTHTGTYPITSVDYSGGVITVAPPCMSNCTDMQPTSTSFGLDWAGPFQLGPSTFILLGCSSSTSSVALRGTFICDASSAYLCATIYSCPAVVALGLPLFPPTNTCCVYSPANLGPRDELDLAELQCAAYSSVAALGDVPTDPARWQYGVALKYTLGGLDDYNMAPSCHGCELSGGVCGYAPPRNSFVCVCGSGNTTTDC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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