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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002745`

染色体: Chr04 坐标: 43128405-43133336 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002745`
名称	SmilChr04G002745
描述	polyadenylate-binding protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	43128405 - 43133336 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021843`
GeneID	`131021843`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021843`
原始查询	`SmilChr04G002745`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyadenylate-binding protein 2-like
产物	polyadenylate-binding protein 2-like
Arabidopsis	`AT5G10350` (AT5G10350) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830899] identity=79.7; qcov=1; evalue=1.16e-124; confidence=high
Rice	`Os02g0757900` (P0471A11.31-2) - identity=73.8; qcov=1; evalue=1.08e-107; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021843

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807146.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057807146.1`
3	Chromatin	染色质	0.60000	`XP_057807146.1`
4	Nuclear speckle	核斑点	0.40000	`XP_057807146.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057807146.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:43128913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:43129142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B90,B92,C31
`Chr4:43132955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C6
`Chr4:43133166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B90,B92,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807146.1

217 aa

108

217

RRM_1

PF00076 RRM_1 91-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807146.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	91	159	2.6e-18	66.3	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951163.1
ATAAAGCCCATATTTAAAGTTTTATGCAGCAACAGCAGTGGTTATCCCCTTTCCGCTCTCTCACACACAAGCACGCTCTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGGAAGAGGAGCATGAGGTGTACGGCGCCGATATACCAGACGTAGGCGAGATGGAAGCCGATGCAGACGTCGACATGCCGGGAGCCGACGATGACGCTGCCGCCAAGGAATTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAGGAGATGGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021843
ATGGAGGAAGAGGAGCATGAGGTGTACGGCGCCGATATACCAGACGTAGGCGAGATGGAAGCCGATGCAGACGTCGACATGCCGGGAGCCGACGATGACGCTGCCGCCAAGGAATTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAGGAGATGGAAGAGGAAGCAGCGGCGCTTCGTGAAATGCAGGCCAAAGTTGAGAAGGAGATGGGTTCTGTTCAAGATCCTGCTAGTACTGCTGCAGCTCAGGCAAACAAGGAGGAGGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807146.1
MEEEEHEVYGADIPDVGEMEADADVDMPGADDDAAAKELDEMKKRLKEMEEEAAALREMQAKVEKEMGSVQDPASTAAAQANKEEVDARSVFVGNVDYACTPEEVQQHFQSCGTVNRVTILTDKFGQPKGFAYVEFIEQEAVQEALQLNESELHGRQLKVMVKRTNVPGMKQYRPRRFNPYLAYGYRRPYAPPHFYSPYGYGKVPRFRRPSRYMPYY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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